CD-HIT搭配nohup

CD-HIT（Cluster Distance Hashing with Iterative Tail Extension）是一种常用的序列相似度聚类算法，它通过计算序列之间的局部相似性来寻找并合并具有高度同源性的簇。而nohup是一个Unix/Linux命令行工具，用于在后台运行命令，并且在终端会话结束时不立即关闭进程。

当结合使用CD-HIT和nohup时，目的是为了让CD-HIT能够在你不直接监控终端的情况下持续运行。以下是简单的步骤：

1. **启动nohup**：首先，你需要在命令行输入`nohup cd-hit [command options] &`，这里的[command options]应替换为你要运行CD-HIT的具体参数，比如输入文件、输出目录等。

2. **隐藏终端输出**：`&` 后面的分号 `;` 可选，可以防止nohup命令立即返回，而是让其在后台运行。这将使得终端窗口不会被占用，你可以看到一条类似“nohup cd-hit...”的信息，表示程序已经启动。

3. **查看日志**：nohup通常会生成一个日志文件，如nohup.out，在当前目录下，你可以通过`cat nohup.out` 查看程序运行情况和错误信息，即使你关闭了终端。