如何安装amber必备的库
时间: 2023-11-24 09:06:11 浏览: 135
安装Amber必备的库需要以下步骤:
1. 安装基本的编译环境,包括C++编译器、Fortran编译器、make、cmake、autoconf、automake等。可以使用系统包管理器进行安装,例如在Ubuntu系统中可以使用以下命令:
```
sudo apt-get install build-essential cmake autoconf automake
```
2. 安装MPI库,MPI是Amber中的一个重要组件,用于并行计算。可以使用系统包管理器安装MPI库,例如在Ubuntu系统中可以使用以下命令:
```
sudo apt-get install libopenmpi-dev
```
3. 安装BLAS和LAPACK库,这是Amber中的另一个重要组件,用于线性代数计算。可以使用系统包管理器安装BLAS和LAPACK库,例如在Ubuntu系统中可以使用以下命令:
```
sudo apt-get install libblas-dev liblapack-dev
```
4. 下载Amber软件包,并解压缩到指定目录。可以从Amber官网上获取最新版本的Amber软件包。
5. 进入Amber软件包的源代码目录,执行以下命令进行配置:
```
./configure -mpi gnu
```
这里使用了GNU编译器作为MPI的后端,如果系统中安装了其他MPI库,可以替换为相应的后端。
6. 执行以下命令进行编译:
```
make -j4
```
这里使用了4个线程进行编译,可以根据实际情况进行调整。
7. 执行以下命令进行安装:
```
sudo make install
```
这里需要使用sudo权限进行安装。
安装完成后,可以通过执行Amber自带的测试脚本进行测试,以确保安装成功。
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