解释这行代码abun=numpy.ones((4,4)) for i in range(4): for j in range(4): f=yy[i,:]-A[j,:] f=((f*f).sum()/n).sqrt() abun[i,j]=f sad1=sad.detach().numpy() print(epoch,loss.data,abun.min(1).mean(),sad1.min(1).mean()) print(abun,sad1)
时间: 2023-06-14 18:06:53 浏览: 110
这段代码的作用是计算一个矩阵 abun 和一个向量 sad1。其中,abun 是一个 4x4 的矩阵,每个元素表示 yy 中的一行与 A 中的一行的欧几里得距离。具体地,对于 abun 的第 i 行第 j 列的元素 abun[i,j],它的值是 yy[i,:] 与 A[j,:] 之间的欧几里得距离。这个距离的计算方式是先将两个向量相减得到一个新的向量 f,然后计算 f 的平方和除以 n(即向量长度)的平方根。这个操作是在一个双重循环中完成的,外层循环遍历 yy 的每一行,内层循环遍历 A 的每一行。
另外,这段代码还有一个语句 sad1=sad.detach().numpy(),它把变量 sad 转换为一个 numpy 数组,并赋值给变量 sad1。这个操作可能是为了后续处理方便,因为 numpy 数组的数学运算比 PyTorch 张量更加灵活和高效。
最后,这段代码还输出了一些结果,包括当前的 epoch 数、loss 的值、abun 矩阵每行最小值的平均值和 sad1 向量每行最小值的平均值,以及 abun 和 sad1 的完整值。
相关问题
直接修改为正确的代码
由于您没有提供具体的上下文,我无法直接修改代码。不过,根据您提到的错误提示,看起来`summarise_all()`函数在尝试计算某列的平均值时遇到了问题。为了修正这个问题,你需要明确地指定要计算平均值的列,例如:
```r
library(tidyverse)
phy <- spe %>%
group_by(tax$genus) %>%
summarise_all(sum) %>%
rename(genus = `tax$genus`) %>%
gather(key="Samples",value = "abun",-genus) %>%
left_join(group,by=c("Samples"="name")) %>%
select(grazing,depth,genus,abun) %>%
group_by(grazing,depth,genus) %>%
summarise(abun = mean(abun)) # 明确指定了要计算mean的列 'abun'
# 如果还有其他需要计算平均的列,请分别指定它们
```
如果还有其他列也需计算平均,可以为那些列添加类似`species_mean = mean(species)`这样的表达式。再次运行这段代码应该会解决问题。如果你仍然遇到问题,记得查看`rlang::last_trace()`的输出以获取更多信息。
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