如何利用DeepView软件执行同源建模，并通过Swiss-PdbViewer界面进行分子的三维可视化展示？

要使用DeepView软件进行同源建模并通过Swiss-PdbViewer界面展示分子的三维结构，首先需要熟悉该软件的用户界面和操作流程。《DeepView用户指南：Swiss-PdbViewer操作手册》是一份非常宝贵的资源，它详细指导了软件的安装、操作以及如何处理蛋白质结构数据。以下是使用DeepView进行同源建模并进行分子可视化的基本步骤：

参考资源链接：[DeepView用户指南：Swiss-PdbViewer操作手册](https://wenku.csdn.net/doc/647d4e5dd12cbe7ec33fbfe9?spm=1055.2569.3001.10343)

1. 启动DeepView并加载目标蛋白的序列数据，这通常是从蛋白质数据库（PDB）中获取。

2. 通过“File”菜单选择“Fetch by ID”，输入蛋白质的PDB ID号，软件将自动下载对应的蛋白质三维结构文件。

3. 在主界面中，利用“Sequence”菜单中的“Align”功能，可以将目标序列与已知结构的同源蛋白进行序列比对。

4. 利用“Tools”菜单下的“Modeling”工具进行同源建模，DeepView会根据序列比对结果，使用内置的建模算法构建目标蛋白的三维结构模型。

5. 在同源建模完成后，可以使用DeepView的分子可视化功能，如“Display”菜单下的各种显示选项，来展示蛋白质的三维结构。可以调整视角、颜色、渲染风格等来获得最佳可视化效果。

6. 为了进一步分析，可以使用“Tools”菜单下的“Analyze”选项，进行蛋白质结构的分析，如活性位点识别、二级结构分析等。

7. 最后，可以将建模结果保存为PDB文件，并使用DeepView的导出功能，将分子图像导出为图片或动画，用于演示或进一步的研究。

为了更深入地理解和操作DeepView，可以参考Gale Rhodes的《分子建模初学者教程》和DeepView的高级教程，这些教程提供了入门到高级的详尽指导，有助于用户充分利用DeepView的强大功能。此外，如果在操作过程中遇到任何问题，可以随时与DeepView团队联系，以获得必要的帮助和资源支持。

参考资源链接：[DeepView用户指南：Swiss-PdbViewer操作手册](https://wenku.csdn.net/doc/647d4e5dd12cbe7ec33fbfe9?spm=1055.2569.3001.10343)