matlab中dendrogram的具体用法
时间: 2023-10-05 11:09:06 浏览: 596
dendrogram是MATLAB中用于绘制树形图的函数,主要用于聚类分析和分类分析中的结果可视化。它可以将数据点按照聚类结果从上到下排列,并用线段将它们连接起来,形成一棵树状结构,方便用户对聚类结果进行直观的观察和分析。
下面是dendrogram函数的具体用法:
1. 语法
dendrogram(Z)
2. 参数说明
参数Z是一个n-1行3列的矩阵,其中Z(i,1)和Z(i,2)表示第i个节点的两个子节点,Z(i,3)表示它们之间的距离。n表示数据点的个数,也就是叶子节点的数量。
3. 返回值说明
dendrogram函数会将树形图绘制在当前图形窗口中,并返回一个长度为n的向量,其中第i个元素表示第i个叶子节点在绘制过程中的位置。
4. 示例代码
以下是一个简单的聚类分析的示例代码,它将20个随机生成的数据点按照距离进行聚类,并使用dendrogram函数绘制树形图:
```matlab
% 生成随机数据
X = rand(20,2);
% 调用linkage函数进行聚类
Z = linkage(X, 'ward');
% 绘制树形图并获取叶子节点位置
leafOrder = dendrogram(Z);
% 将叶子节点位置作为x坐标,数据点的第一个特征作为y坐标进行散点图绘制
scatter(leafOrder, X(:,1));
```
上述代码会生成一个包含树形图和散点图的图形窗口,其中树形图展示了聚类结果,散点图展示了数据点在x轴上的位置和第一个特征的值。
相关问题
dendrogram函数 matlab
### Matlab 中 `dendrogram` 函数的使用方法
在 Matlab 中,`dendrogram` 函数用于绘制层次聚类树图。该函数接受由 `linkage` 函数返回的聚类树矩阵作为输入参数,并可以显示不同级别的聚类情况。
#### 基本语法
最简单的调用方式如下所示:
```matlab
h = dendrogram(Z);
```
其中 `Z` 是通过 `linkage` 函数计算得到的聚类树矩阵[^1]。
为了指定要展示的最大簇数,可采用以下形式:
```matlab
h = dendrogram(Z, P);
```
这里 `P` 表示希望看到的最大子节点数目,默认情况下会显示所有可能的分支。
如果想要获取更多控制权,则可以通过设置属性名称-值对来调整图形外观:
```matlab
h = dendrogram(___, 'Orientation', orient, 'ColorThreshold', threshold);
```
此命令允许改变树状图的方向 (`orient`) 和颜色阈值 (`threshold`) 来区分不同的簇群。
#### 示例代码
下面是一个完整的例子,展示了如何创建并可视化一个简单数据集上的分层聚类结果:
```matlab
% 生成随机样本点
X = rand(10, 2);
% 计算欧几里得距离矩阵
D = pdist(X);
% 执行凝聚型层次聚类算法
Z = linkage(D, 'ward');
% 绘制聚类树形图
figure;
h = dendrogram(Z);
title('Hierarchical Clustering Dendrogram');
xlabel('Sample Index or (Cluster Index)');
ylabel('Distance');
set(gca,'TickDir','out','XTickLabel',{'a';'b';'c';'d';'e';'f';'g';'h';'i';'j'});
```
上述脚本首先生成了一些二维空间内的随机坐标位置,接着利用这些点之间的欧式距离进行了 Ward 方法下的层次聚类分析,最后画出了相应的树形结构图。
matlab linkage用法
在MATLAB中,`linkage`函数用于计算数据点之间的聚类树(也称为Dendrogram),这是一种可视化聚类结果的数据结构。它主要用于层次聚类(Hierarchical Clustering)算法,如单链接(single linkage)、完全链接(complete linkage)、平均链接(average linkage)和 ward's method等。
基本语法是:
```matlab
Z = linkage(X, method)
```
- `X`:输入的数据集,通常是一个矩阵,其中每一行代表一个观测值,每一列代表一个变量。
- `method`:聚类方法的选择,可以是字符串(如'ward', 'single', 'complete', 'average'等)或对应的数值标识。常见的几种方法含义如下:
- `'ward'`:Ward's minimum variance method。
- `'single'`:单链(最小距离)。
- `'complete'`:全连接(最大距离)。
- `'average'`:平均连接(所有路径的平均距离)。
`linkage`函数返回的结果`Z`是一个二维数组,它记录了每个数据点合并过程中的祖先节点,通常用于绘制Dendrogram。你可以使用`dendrogram`函数来展示这个聚类树。
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