ggplot(median_T, aes(x = Tissue, y = aov_cpm_median_T_means)) + + geom_boxplot(width = 2, outlier.shape = NA) + + scale_x_discrete(linetype = "solid", color = "black") + + scale_y_continuous(linetype = "solid", color = "black") + + theme_classic() + + theme(panel.grid.major = element_blank(), + panel.grid.minor = element_blank(), + panel.border = element_blank(), + axis.line = element_line(color = "black", size = 0.5), + axis.text = element_text(size = 12), + axis.title = element_text(size = 14), + plot.title = element_text(size = 16, face = "bold"), + plot.subtitle = element_text(size = 14), + plot.caption = element_text(size = 12), + legend.position = "none") Error in discrete_scale(c("x", "xmin", "xmax", "xend"), "position_d", : unused arguments (linetype = "solid", color = "black")

在这段代码中，你使用 ggplot2 绘图包来绘制一个箱线图。首先，你指定了数据框 median_T，然后使用 aes() 函数来设置 x 轴为 Tissue，y 轴为 aov_cpm_median_T_means。接着，你使用 geom_boxplot() 函数来绘制箱线图，并设置参数 width = 2 来控制箱体的宽度，outlier.shape = NA 来指定离群值不显示。

然而，在这段代码中，你试图为 scale_x_discrete() 和 scale_y_continuous() 函数设置 linetype 和 color 参数，这是不正确的。这些参数只适用于连续变量的标度，而不适用于离散变量的标度。如果你想为离散变量的标度设置颜色和样式，可以使用 scale_color_manual() 和 scale_linetype_manual() 函数。

此外，你还设置了一个 theme_classic() 函数来设置图形的主题，但是后面又使用了 theme() 函数来修改主题。这两个函数只需要使用一个即可。

可以将代码修改为如下：

ggplot(median_T, aes(x = Tissue, y = aov_cpm_median_T_means)) +
  geom_boxplot(width = 2, outlier.shape = NA) +
  scale_x_discrete() +
  scale_y_continuous() +
  scale_color_manual(values = "black") +
  scale_linetype_manual(values = "solid") +
  theme_classic() +
  theme(
    panel.grid.major = element_blank(),
    panel.grid.minor = element_blank(),
    panel.border = element_blank(),
    axis.line = element_line(color = "black", size = 0.5),
    axis.text = element_text(size = 12),
    axis.title = element_text(size = 14),
    plot.title = element_text(size = 16, face = "bold"),
    plot.subtitle = element_text(size = 14),
    plot.caption = element_text(size = 12),
    legend.position = "none"
  )

这将为箱线图的轮廓线设置黑色颜色和实线样式，并设置了一些主题参数以自定义图形的外观。