1、怎么检查我当前的GATK版本？ 2、如何在Linux环境下设置PATH以寻找GATK？

1. **检查GATK版本**：在Unix/Linux或MacOS终端中，你可以输入以下命令：

   gatk --version

或者，如果你的GATK是在某个特定目录（比如`~/tools/GATK`）中，可以尝试：

   ~/tools/GATK/gatk --version

Windows用户则可以在命令提示符（CMD）或PowerShell中类似操作。

2. **设置PATH查找GATK（Linux）**：
- 打开终端，并打开`.bashrc`或`.bash_profile`文件（通常位于`~/.bashrc`或`~/.bash_profile`，如果你使用的是Zsh，可能是`~/.zshrc`）。
- 在文件底部添加一行，指定GATK的安装路径，如：

     export PATH=$PATH:/path/to/your/GATK/installation

- 保存文件后，输入 `source ~/.bashrc` （或相应文件名）让更改生效。
- 现在，终端应该能够找到GATK了，可以直接运行`gatk`命令。

如果在设置PATH之后仍然无法找到GATK，确认一下环境变量是否已被正确更新，或者直接输入完整路径来执行命令。