生成使用r语言对framingham数据进行判别分析的完整代码
时间: 2024-12-23 08:12:21 浏览: 19
在R语言中,我们可以使用` discriminantAnalysis()` 函数来进行判别分析,这里以Framingham心血管疾病研究数据集为例。首先,你需要安装并加载必要的包,如`MASS`,然后导入数据。以下是一个完整的代码示例:
```R
# 安装并加载所需的包
if (!require("MASS")) {
install.packages("MASS")
}
library(MASS)
# 加载Framingham数据集 (如果数据不在你的工作目录下,需要先下载)
data(Framingham)
# 检查数据集
head(Framingham) # 查看数据前几行
# 假设我们想要基于 'TenYearCHD', 'Age', 'Sex', 'SysBP', 'DiastolicBP', 'Cholesterol' 这些特征来预测是否有十年内的心脏病发作
predictors <- c('TenYearCHD', 'Age', 'Sex', 'SysBP', 'DiastolicBP', 'Cholesterol')
response <- 'TenYearCHD'
# 数据预处理(如果有缺失值,可以考虑用平均值、中位数填充)
Framingham[is.na(Framingham)] <- mean(Framingham, na.rm = TRUE) # 假设所有列都有相同数量的缺失值,可以用其他方法替换
# 划分训练集和测试集(可以根据实际情况调整比例)
set.seed(123) # 设置随机种子保证结果可复制
trainIndex <- sample(1:nrow(Framingham), nrow(Framingham) * 0.7) # 70%的数据用于训练,30%用于测试
trainData <- Framingham[trainIndex, predictors]
testData <- Framingham[-trainIndex, predictors]
trainResponse <- trainData[, response]
testResponse <- testData[, response]
# 进行判别分析
lda_model <- lda(response ~ ., data = trainData)
# 预测测试集的结果
predictions <- predict(lda_model, testData)
# 查看模型性能
confusionMatrix(predictions, testResponse) # 可视化混淆矩阵
# 可视化决策边界(如果数据可视化可用ggplot2或plotly)
if ("ggplot2" %in% installed.packages()) {
library(ggplot2)
plot(lda_model$call)
}
```
这个代码展示了如何使用判别分析进行预测,并给出了评估模型性能的方法。注意,这只是一个基础示例,实际应用可能需要根据数据特性和需求进行更多的数据清理和特征工程。
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