nii格式数据读取并处理

NII (Neuro Imaging Informatics Technology Initiative) 是一种专门用于存储神经影像学数据的标准文件格式，它包含了脑部扫描等各种类型的医学图像信息，以及相关的元数据。读取和处理 NII 数据通常涉及以下几个步骤：

1. **库依赖**：首先需要使用支持 NII 格式的数据处理库，例如 Python 中的 nibabel 库，它是专为处理各种 neuroimaging 格式（包括 NII）设计的。

import nibabel as nib

2. **加载数据**：使用 `nibabel.load()` 函数读取 NII 文件，它会返回一个 `Nifti1Image` 或 `Nifti2Image` 对象，其中包含了实际的图像数据和元数据。

image = nib.load('example.nii.gz')

3. **查看信息**：可以使用 `.header` 属性获取元数据，如空间定位、尺寸等；`.get_fdata()` 获取数组形式的图像数据。

metadata = image.header
image_data = image.get_fdata()

4. **处理数据**：根据需求对数据进行预处理，比如调整大小、归一化、滤波等。这可能涉及到 NumPy 或其他科学计算库。

5. **保存处理后的数据**：如果需要，可以用 `nib.save()` 函数将处理后的数据保存回新的 NII 文件。

processed_image = ... # 处理后的数据
output_nii = nib.Nifti1Image(processed_image, metadata['pixdim'], metadata['affine'])
nib.save(output_nii, 'processed_example.nii.gz')