ncbi在线blast结果

NCBI（美国国家生物技术信息中心）的在线BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是一种用于比对和比较核酸和蛋白质序列的工具。它被广泛应用于寻找序列相似性和功能注释。

在线BLAST的使用非常简便。首先，将待比对的序列复制到输入框中，并选择比对类型（核酸-核酸、蛋白-蛋白）和数据库。然后，点击运行BLAST按钮，系统会自动将输入序列与所选择的数据库中的序列进行比对。

比对结果以表格形式展示，其中包含多个重要信息。首先，每个比对结果都有一个E值，用于描述比对的期望统计值，E值越小表示比对结果越可靠。比对结果还显示了比对的得分和匹配长度，可以帮助用户评估比对的质量。

比对结果还提供了比对序列的相似性：BLAST将输入序列与数据库中的序列逐个比对，并根据序列相似性分数进行排序。用户可以根据比对结果中的相似性和得分选择相应的比对序列。

此外，结果还提供了对比对序列的注释信息。通过比对结果，用户可以了解比对序列在数据库中可能的功能和相关信息，帮助进一步理解序列的生物学意义。

总之，NCBI的在线BLAST提供了一种简单而强大的工具，用于比较和注释生物序列。通过比对结果，用户可以评估序列相似性和功能，并深入研究序列的生物学意义。

相关问题

NCBI的BLAST下载

您可以通过 NCBI 的网站下载 BLAST 软件和数据库。

1. 访问 NCBI 的 BLAST 页面：https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

2. 在页面上方的“Downloads”下拉菜单中选择“Standalone BLAST”，然后选择适合您操作系统的版本进行下载。

3. 下载完毕后，解压文件并按照说明进行安装。

4. BLAST 软件需要使用相应的数据库进行搜索，您可以在“Downloads”下拉菜单中选择“BLAST Databases”下载所需的数据库。根据您需要搜索的目标生物的不同，可选择不同的数据库，如人类基因组数据库、大肠杆菌数据库等。

5. 下载完数据库后，将其解压到您指定的位置。

6. 打开 BLAST 软件，选择要搜索的数据库和查询序列文件，设置搜索参数，即可开始搜索。

linux系统安装ncbi-blast

在Linux系统上安装NCBI BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)，通常需要通过包管理器来进行。以下是基于Ubuntu和CentOS系统的安装步骤：

**对于Ubuntu系统：**
1. 打开终端：

   $ sudo apt-get update

2. 安装BLAST+工具：

   $ sudo apt-get install ncbi-blast+

如果遇到版本更新的问题，可以访问NCBI官网下载最新的blast+源码并自行编译。

**对于CentOS/RHEL系统（使用Epel存储库）：**
1. 添加EPEL仓库：

   $ sudo yum install epel-release

2. 更新软件包列表：

   $ sudo yum update

3. 安装NCBI BLAST：

   $ sudo yum install ncbiblastplus

**相关问题--:**
1. 在缺少官方软件源的情况下如何手动编译安装？
2. 如何检查BLAST是否已经成功安装？
3. 安装过程中遇到依赖缺失应该怎么做？