请对你个Linux零基础的学习者将将文档中的内容，另外如何在主机的虚拟机中下载GETM源码

### 文档内容概述

该文档 `configure.sh.txt` 是一个用于配置和编译 GETM（General Estuarine Transport Model）模型的 shell 脚本。以下是脚本的主要步骤：

1. **设置环境变量**：
- `GETM_BASE`: GETM 代码的路径，默认为 `/home/bing3/github/GETM_SED_DENSITY/SEDIMENT/getm/code`。
- `GOTM_BASE`: GOTM 代码的路径，默认为 `/home/bing3/github/GETM_SED_DENSITY/SEDIMENT/gotm/code`。
- `FABM_BASE`: FABM 代码的路径，默认为 `/home/bing3/github/GETM_SED_DENSITY/SEDIMENT/fabm/code`。
- `compiler`: 编译器，默认为 `mpifort`。
- `coordinate`: 坐标系，默认为 `Cartesian`。
- `install_prefix`: 安装路径，默认为当前目录。

2. **修改源代码文件**：
- 将当前目录下的 `dimensions.h` 文件复制到 `GETM_BASE/include` 目录下。
- 将当前目录下的 `vv_momentum_3d.F90` 和 `residual.F90` 文件复制到 `GETM_BASE/src/3d` 目录下。

3. **创建并进入编译目录**：
- 创建一个与编译器同名的目录，并进入该目录。

4. **生成 Makefile**：
- 使用 CMake 生成 Makefile，指定各种配置选项，包括安装路径、使用 FABM、编译器、坐标系等。

5. **编译和安装**：
- 进入编译目录，执行 `make` 命令进行编译，并安装生成的可执行文件。
- 将安装后的 `getm` 可执行文件移动到当前目录。

6. **清理临时文件**：
- 删除编译目录和安装路径下的二进制文件。

### 如何在主机的虚拟机中下载 GETM 源码

假设你在虚拟机中已经安装了 Git，可以通过以下步骤下载 GETM 源码：

1. **打开终端**：
在虚拟机中打开终端窗口。

2. **安装 Git**（如果未安装）：

   sudo apt-get update
   sudo apt-get install git

3. **克隆 GETM 仓库**：
根据文档中的路径，你可以克隆 GETM 仓库到指定目录。例如：

   cd /home/bing3/github
   mkdir -p GETM_SED_DENSITY/SEDIMENT
   cd GETM_SED_DENSITY/SEDIMENT
   git clone https://github.com/your-username/getm.git code

请将 `https://github.com/your-username/getm.git` 替换为你实际的 GETM 仓库地址。

4. **验证下载**：
进入 `code` 目录，查看是否成功下载了源码：

   cd code
   ls

通过以上步骤，你可以在虚拟机中成功下载并配置 GETM 源码。如果有任何疑问或遇到问题，请随时提问。