请对你个Linux零基础的学习者将将文档中的内容，另外如何将主机Windows系统得到的GETM源码运用到主机的虚拟机中

### 文档 `configure.sh.txt` 内容概述

该脚本用于配置和编译一个名为 GETM（General Estuarine Transport Model）的海洋模型。以下是脚本的主要步骤和功能：

1. **设置代码路径**：
- `GETM_BASE`: GETM 代码的基本路径，默认为 `/home/bing3/github/GETM_SED_DENSITY/SEDIMENT/getm/code`。
- `GOTM_BASE`: GOTM 代码的基本路径，默认为 `/home/bing3/github/GETM_SED_DENSITY/SEDIMENT/gotm/code`。
- `FABM_BASE`: FABM 代码的基本路径，默认为 `/home/bing3/github/GETM_SED_DENSITY/SEDIMENT/fabm/code`。

2. **指定编译器**：
- `compiler`: 默认使用 `mpifort` 作为编译器。

3. **指定坐标系**：
- `coordinate`: 默认使用 `Cartesian` 坐标系。

4. **指定安装路径**：
- `install_prefix`: 安装路径默认为当前目录。

5. **并行计算和静态编译**：
- 修改 `dimensions.h` 和 `vv_momentum_3d.F90` 文件以适应并行计算和静态编译的需求。
- 使用 `cp` 命令将这些文件链接到相应的位置。

6. **编译过程**：
- 创建编译目录并进入该目录。
- 使用 `cmake` 进行配置，指定各种选项如安装路径、编译器等。
- 返回上一级目录并进行构建。
- 将生成的可执行文件移动到当前目录。
- 删除编译过程中产生的临时文件。

### 如何在 Windows 主机上获取 GETM 源码并在虚拟机中使用

1. **在 Windows 主机上获取 GETM 源码**：
- 打开浏览器，访问 GETM 的 GitHub 仓库地址（例如：https://github.com/GETM-Community/GETM）。
- 克隆仓库到本地磁盘，可以使用 Git Bash 或其他工具：

     git clone https://github.com/GETM-Community/GETM.git

2. **将源码传输到虚拟机**：
- **方法一：通过共享文件夹**：
1. 在虚拟机软件（如 VirtualBox 或 VMware）中设置共享文件夹。
2. 将 Windows 上的 GETM 源码目录添加为共享文件夹。
3. 在虚拟机中挂载共享文件夹：

        sudo mount -t vboxsf <共享文件夹名称> /mnt/shared_folder

4. 复制源码到虚拟机中的合适位置：

        cp -r /mnt/shared_folder/GETM /home/<用户名>/GETM

- **方法二：通过网络传输**：
1. 在 Windows 上启动 FTP 服务器或使用文件传输工具（如 WinSCP）。
2. 在虚拟机中使用 FTP 客户端或 SCP 命令下载源码：

        scp -r user@windows_ip:/path/to/GETM /home/<用户名>/GETM

3. **在虚拟机中编译和运行 GETM**：
- 确保虚拟机中已安装必要的依赖项（如 MPI、Fortran 编译器等）。
- 将上述 `configure.sh` 脚本复制到虚拟机中，并根据实际情况调整路径和其他配置。
- 运行脚本进行编译和安装：

     chmod +x configure.sh
     ./configure.sh

通过以上步骤，你可以在 Windows 主机上获取 GETM 源码，并将其成功应用到 Linux 虚拟机中进行编译和运行。