基于分水岭算法的肺部医学图像分割算法代码实现
时间: 2023-09-01 21:11:37 浏览: 114
肺部图像分割功能实现-标记的分水岭分割算
由于肺部医学图像分割算法包括多种方法,基于分水岭算法的实现也有多种,以下是一种基于OpenCV库的实现方法:
```python
import cv2
import numpy as np
# 读取图像
img = cv2.imread('lung.jpg')
# 灰度化
gray = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_BGR2GRAY)
# 二值化
ret, thresh = cv2.threshold(gray, 0, 255, cv2.THRESH_BINARY_INV+cv2.THRESH_OTSU)
# 膨胀操作
kernel = np.ones((3,3),np.uint8)
opening = cv2.morphologyEx(thresh,cv2.MORPH_OPEN,kernel, iterations = 2)
# 距离变换
dist_transform = cv2.distanceTransform(opening,cv2.DIST_L2,5)
ret, sure_fg = cv2.threshold(dist_transform,0.7*dist_transform.max(),255,0)
# 背景区域
sure_bg = cv2.dilate(opening,kernel,iterations=3)
# 不确定区域
sure_fg = np.uint8(sure_fg)
unknown = cv2.subtract(sure_bg,sure_fg)
# 标记连通区域
ret, markers = cv2.connectedComponents(sure_fg)
# 增加1,保证背景区域不为0
markers = markers+1
# 不确定区域标记为0
markers[unknown==255] = 0
# 分水岭算法
markers = cv2.watershed(img,markers)
img[markers == -1] = [0,0,255]
# 显示结果
cv2.imshow('result', img)
cv2.waitKey(0)
cv2.destroyAllWindows()
```
其中,`lung.jpg`为肺部医学图像文件名,可以根据实际情况进行修改。该代码实现了以下步骤:
1. 将图像转换为灰度图并进行二值化。
2. 对二值化后的图像进行膨胀操作。
3. 对膨胀后的图像进行距离变换,得到前景区域。
4. 对膨胀后的图像进行腐蚀操作,得到背景区域。
5. 将前景区域和背景区域合并得到标记图像。
6. 对标记图像进行分水岭算法。
7. 将分割结果可视化并显示。
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