/etc/init.d/mysql: line 338: read: read error: 0: Is a directory

这个错误通常是由于 MySQL 无法读取其配置文件而导致的。你可以尝试以下步骤来解决这个问题：

1. 确认 MySQL 配置文件的位置是否正确。默认情况下，MySQL 配置文件位于 `/etc/mysql/my.cnf`。

2. 确认 MySQL 配置文件的权限是否正确。使用 `ls -l /etc/mysql/my.cnf` 命令检查文件权限是否正确。如果权限不正确，可以使用 `chmod` 命令进行更改。

3. 确认 MySQL 数据库目录的权限是否正确。使用 `ls -ld /var/lib/mysql` 命令检查目录权限是否正确。如果权限不正确，可以使用 `chmod` 命令进行更改。

4. 确认 MySQL 数据库目录是否存在。如果不存在，则需要创建该目录并设置正确的权限。

如果以上步骤都无法解决问题，可以尝试重新安装 MySQL 或者联系 MySQL 的支持团队进行进一步的帮助。