谱聚类算法Python
时间: 2023-11-05 08:22:29 浏览: 117
谱聚类算法是一种流行的聚类算法,其性能和适用场景优于传统的聚类算法,如k-均值算法。该算法的详细总结可以在论文《A Tutorial on Spectral Clustering》中找到。在Python中,可以使用scikit-learn库来实现谱聚类算法。在使用scikit-learn库中的谱聚类算法时,有一个重要的参数是n_clusters,代表切图时降维到的维数,同时也是最后一步聚类算法聚类到的维数。这个参数可以通过调参选择最优值。然而,要完全理解谱聚类算法,需要对图论中的无向图、线性代数和矩阵分析有一定的了解。在Python中,可以使用scikit-learn库中的SpectralClustering类来实现谱聚类算法。可以通过指定参数来进行调参并使用该类进行聚类分析。<span class="em">1</span><span class="em">2</span><span class="em">3</span>
相关问题
谱聚类算法python代码
以下是一个简单的python代码实现谱聚类算法:
```python
import numpy as np
from sklearn.cluster import KMeans
def similarity_matrix(X, sigma=1.0):
n = X.shape[0]
S = np.zeros((n, n))
for i in range(n):
for j in range(n):
if i != j:
diff = X[i] - X[j]
S[i][j] = np.exp(-np.dot(diff, diff) / (2.0 * sigma**2))
return S
def laplacian_matrix(S):
n = S.shape[0]
D = np.diag(np.sum(S, axis=1))
L = D - S
return L
def spectral_clustering(X, k, sigma=1.0):
S = similarity_matrix(X, sigma)
L = laplacian_matrix(S)
eig_vals, eig_vecs = np.linalg.eig(L)
idx = eig_vals.argsort()[:k]
eig_vecs = eig_vecs[:, idx]
norm_sq = np.sum(eig_vecs**2, axis=1, keepdims=True)
Y = eig_vecs / np.sqrt(norm_sq)
kmeans = KMeans(n_clusters=k, random_state=0).fit(Y)
return kmeans.labels_
```
该代码包含了以下功能:
- `similarity_matrix(X, sigma=1.0)`:计算样本点之间的相似度矩阵。
- `laplacian_matrix(S)`:计算拉普拉斯矩阵。
- `spectral_clustering(X, k, sigma=1.0)`:实现谱聚类算法,返回聚类标签。
注意,该代码使用了scikit-learn中的KMeans模型进行最终的聚类,因此需要事先安装scikit-learn。此外,该代码实现了简单的谱聚类算法,可能在实际应用中需要进行优化和改进。
请用python自创一个数据集写一个谱聚类算法python代码
谱聚类是一种非监督学习技术,它将数据点视为图中节点,并利用节点之间的相似度构建一个图的拉普拉斯矩阵来进行聚类。下面是一个简单的Python代码示例,我们将使用Scipy库中的`spectral_clustering`函数实现谱聚类:
```python
import numpy as np
from sklearn.datasets import make_blobs
from scipy.sparse.csgraph import laplacian
from sklearn.cluster import SpectralClustering
# 创建一个样本数据集
n_samples, n_features = 50, 10
random_state = 42
X, y_true = make_blobs(n_samples=n_samples, centers=3, random_state=random_state)
# 将数据转换为拉普拉斯矩阵
affinity_matrix = np.dot(X, X.T) # 邻接矩阵,可以换成其他相似度计算方式(如cosine similarity)
laplacian_matrix = laplacian(affinity_matrix, normed=True) # 归一化拉普拉斯矩阵
# 定义并运行谱聚类
spectral_clustering_model = SpectralClustering(n_clusters=3, affinity='precomputed') # 3个聚类中心
labels = spectral_clustering_model.fit_predict(laplacian_matrix)
# 打印预测的标签以及与真实标签的对比
print("Predicted labels:", labels)
print("Accuracy:", np.mean(labels == y_true))
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