写一个严谨的python脚本，不使用外部模块提取文件中第三列为mRNA的行

好的，以下是一个严谨的Python脚本，可以提取文件中第三列为mRNA的行：

with open("filename.txt", "r") as file:
    for line in file:
        columns = line.strip().split("\t")
        if len(columns) >= 3 and columns[2] == "mRNA":
            print(line.strip())

请将"filename.txt"替换为你想要提取的文件名。该脚本将逐行读取文件，并将每行拆分为一个列列表。然后，它检查列表是否具有至少三列，并且第三列是否为“mRNA”。如果是这样，它将打印该行（剥离换行符）。

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写一个严谨的python脚本，不使用外部模块提取输入文件中第三列为mRNA的行

好的，以下是一个严谨的Python脚本，可以从输入文件中提取第三列为mRNA的行：

import sys

input_file = sys.argv[1]

with open(input_file, "r") as file:
    for line in file:
        columns = line.strip().split("\t")
        if len(columns) >= 3 and columns[2] == "mRNA":
            print(line.strip())

请在命令行中运行脚本，并将输入文件名作为参数传递给脚本，例如：

python script.py input_file.txt

该脚本首先从命令行参数中获取输入文件名。然后，它逐行读取输入文件，并将每行拆分为一个列列表。然后，它检查列表是否具有至少三列，并且第三列是否为“mRNA”。如果是这样，它将打印该行（剥离换行符）。

写一个严谨的python脚本，不使用外部模块提取输入fa文件中第三列为mRNA的行并写入一个新的fa文件中

好的，以下是一个严谨的Python脚本，可以从输入fa文件中提取第三列为mRNA的行，并将其写入一个新的fa文件：

import sys

input_file = sys.argv[1]
output_file = sys.argv[2]

with open(input_file, "r") as input, open(output_file, "w") as output:
    line_count = 0
    for line in input:
        line_count += 1
        if line_count % 2 == 0:  # skip even-numbered lines (sequence lines)
            continue
        columns = line.strip().split("\t")
        if len(columns) >= 3 and columns[2] == "mRNA":
            output.write(line)  # write both the header and sequence lines
            output.write(next(input))  # write the next line (sequence line)

请在命令行中运行脚本，并将输入fa文件名和输出fa文件名作为参数传递给脚本，例如：

python script.py input.fa output.fa

该脚本首先从命令行参数中获取输入文件名和输出文件名。然后，它逐行读取输入文件，并将每行分为标题和序列行。标题行包含第三列，因此如果该列为“mRNA”，则将该行写入输出文件（同时写入标题行和下一个序列行）。否则，跳过该行并继续读取下一行。最后，输出文件将包含第三列为“mRNA”的标题和序列行。