怎么绘制cd40的log-log图,模型是model1 <- coxph(Surv(days, cens) ~ factor(arms) + cd40 + age + wtkg + homo + race + gender, data = data)
时间: 2023-12-23 19:01:55 浏览: 72
深度学习年龄和性别识别模型
要绘制 cd40 变量的 log-log 图,可以按照以下步骤进行操作:
1. 使用 `resid` 函数获取 Cox 模型的残差:
```
resid1 <- resid(model1, type = "scaledsch")
```
2. 使用 `ggplot2` 包绘制 log-log 图:
```
library(ggplot2)
ggplot(data.frame(x = model1$time, y = resid1), aes(x = log(model1$time), y = log(-log(resid1)))) +
geom_point() +
xlab("log(Time)") +
ylab("log(-log(Survival Probability))") +
ggtitle("Log-Log Plot of CD40")
```
其中,`model1$time` 表示 Cox 模型中的时间变量,`resid1` 表示 Cox 模型的残差,`log(-log(resid1))` 表示 Cox 模型的 log(-log) 残差。在图中,横轴为 log(Time),纵轴为 log(-log(Survival Probability)),每个点表示一个观测值的残差。
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