featureCounts_mqc-generalstats-featurecounts-percent_assigned是什么意思
时间: 2023-12-13 21:04:12 浏览: 140
featureCounts是一种RNA-Seq数据分析工具,用于计算基因或转录本的表达量。在featureCounts的输出结果中,generalstats部分涵盖了各种关于数据质量和mapping的统计信息,其中percent_assigned指的是已经被成功分配到基因或转录本的比例。这个指标可以用来评估RNA-Seq数据的mapping效率和数据质量。意思是在所有的reads中,有多少比例的reads被成功的分配到了基因或转录本。
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featureCounts_mqc-generalstats-featurecounts-percent_assigned
根据您提供的信息,我猜测您在讨论RNA-Seq数据分析中的质量控制部分。featureCounts是一种RNA-Seq数据分析工具,用于计算基因或转录本的表达量。在featureCounts的输出结果中,generalstats部分涵盖了各种关于数据质量和mapping的统计信息,其中percent_assigned指的是已经被成功分配到基因或转录本的比例。这个指标可以用来评估RNA-Seq数据的mapping效率和数据质量。
使用mqc实
现在我来介绍一下如何使用MQC(模糊质量控制)。
首先,MQC是一个用于网络流量管理的工具,它可以帮助网络管理员实现对网络流量的限制和控制。下面是使用MQC的基本步骤:
1. 创建一个类映射
在MQC中,类映射是将数据包分类为不同类别的过程。要创建一个类映射,您需要指定一个唯一的名称和一个匹配条件。例如,下面的命令将创建一个名为“ftp-class”的类映射,该类映射将匹配所有的FTP流量:
```
class-map ftp-class
match protocol ftp
```
2. 创建一个策略映射
策略映射将类映射与特定操作(例如限制带宽或丢弃数据包)相关联。要创建一个策略映射,您需要指定一个唯一的名称、一个类型(例如限制带宽或丢弃数据包)和一个关联的类映射。例如,下面的命令将创建一个名为“limit-ftp”的策略映射,该策略映射将限制FTP流量的带宽为1Mbps:
```
policy-map limit-ftp
class ftp-class
police 1000000 conform-action transmit exceed-action drop
```
3. 将策略映射应用到接口
要将策略映射应用到接口,您需要使用“service-policy”命令。例如,下面的命令将将名为“limit-ftp”的策略映射应用到接口“GigabitEthernet0/1”:
```
interface GigabitEthernet0/1
service-policy input limit-ftp
```
这些是使用MQC的基本步骤。当然,MQC具有更多的功能和选项,例如可以使用不同的匹配条件、操作和策略映射类型来实现更复杂的网络流量管理。
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