Ubuntu虚拟机安装蛋白设计软件rosetta

Ubuntu虚拟机上安装Rosetta（蛋白质设计软件）需要几个步骤：

1. 准备工作：
- 首先，确保你在Ubuntu系统上已经安装了必要的库和开发工具，如`git`, `build-essential`, 和`software-properties-common`等。你可以通过终端运行命令：

   sudo apt update && sudo apt install git cmake build-essential software-properties-common

2. 安装依赖项：
Rosetta需要一些特定的科学计算库，例如OpenMPI、CUDA（如果你计划用GPU加速），可以分别安装：
- 对于CPU版本：

   sudo apt install openmpi-bin libopenmpi-dev

- 对于GPU加速，你需要安装CUDA和对应的驱动，并设置环境变量。首先检查CUDA是否已安装，然后添加CUDA repositories并安装：

   curl https://developer.nvidia.com/cuda-repo/ubuntu1804 | sudo bash -
   sudo apt-get update && sudo apt-get install cuda

完成后配置环境变量。

3. 下载并构建Rosetta：
- 使用`git`从Rosetta GitHub仓库克隆：

   git clone https://github.com/riptideio/rosetta.git

- 进入目录并初始化Git submodule:

   cd rosetta
   git submodule update --init

- 构建软件：

   mkdir build && cd build
   cmake ..
   make -j$(nproc) # 根据你的CPU核心数调整“-j”参数

4. 安装和测试：
- 如果一切顺利，你可以通过`make install`命令将Rosetta安装到系统默认位置。然后确认安装路径（通常在 `/usr/local` 或者自定义的路径下），并测试基本功能：

   scons bin mode=release
   ./scons/bin/mini.rosetta.linuxgccrelease

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