使用python将aas表中的第一列片段,每七个字符变成一个新的片段,且每个片段继承原片段的其他属性,将新生成的数据存到mysql数据库hh表中
时间: 2024-01-21 19:18:28 浏览: 84
假设aas表的结构为:
| id | sequence | length | name |
|----|----------|--------|------|
| 1 | ATCG... | 100 | seq1 |
| 2 | ATCG... | 200 | seq2 |
| 3 | ATCG... | 150 | seq3 |
可以使用以下代码实现:
```python
import mysql.connector
# 连接数据库
db = mysql.connector.connect(
host="localhost",
user="yourusername",
password="yourpassword",
database="yourdatabase"
)
# 获取aas表中的数据
cursor = db.cursor()
cursor.execute("SELECT * FROM aas")
data = cursor.fetchall()
# 将第一列片段每七个字符变为一个新片段,并插入到hh表中
for row in data:
sequence = row[1]
new_sequence = [sequence[i:i+7] for i in range(0, len(sequence), 7)]
for new_seq in new_sequence:
sql = "INSERT INTO hh (sequence, length, name) VALUES (%s, %s, %s)"
val = (new_seq, row[2], row[3])
cursor.execute(sql, val)
# 提交更改并关闭连接
db.commit()
db.close()
```
这个代码将会将aas表中的每一个序列,每七个字符切分为一个新的片段,并将新的片段插入到hh表中,同时保留原始片段的其他属性。
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