怎么使用pubmlst网站分析cgmlst并下载结果做进化树
时间: 2023-08-07 22:03:16 浏览: 286
如何使用软件构建进化树
以下是使用 PubMLST 网站分析 cgMLST 并下载结果以制作进化树的步骤:
1. 打开 PubMLST 网站(https://pubmlst.org/)并选择你要分析的物种。
2. 选择 "cgMLST" 选项卡,并选择 "cgMLST Schema" 列表中的一个模式。
3. 在 "Perform analysis" 部分输入你的序列数据。
4. 点击 "Submit analysis" 按钮开始分析。
5. 分析完成后,你可以在 "Download results" 部分下载分析结果。
6. 下载 "allele calls" 文件,并将其转换为适合制作进化树的格式。
7. 使用适当的进化树软件(如MEGA或PHYLIP)制作进化树。
注意:在进行cgMLST分析之前,你需要使用合适的软件对序列数据进行质量控制和去除低质量序列。
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