Error in grDevices::pdf(file = filename, ..., version = version) : unused argument (theme = list(list()))

这个错误通常是由于在使用`ggsave()`函数保存图形时，将`theme`参数用了一个空的列表，即`theme = list(list())`，导致出现了无效参数的错误。解决方法是将`theme`参数设为空值即可，即`theme = NULL`。具体操作如下：

library(ggplot2)
# 创建一个示例数据集
data <- data.frame(x = c(1,2,3), y = c(2,3,4))

# 绘制散点图
p <- ggplot(data, aes(x, y)) +
  geom_point() + 
  theme(panel.border = element_blank(),
        panel.grid.major = element_blank(),
        panel.grid.minor = element_blank(),
        axis.line = element_line(colour = "black"))

# 保存图形并去除边框
ggsave("plot.pdf", plot = p, width = 6, height = 4, dpi = 300, theme = NULL)

在`ggsave()`函数中，`theme`参数设置为空值即可。

相关问题

showDatabaseCategory(CellChatDB) #作 者提供了可视化的代码，可以看到该数据库中“Secreted Signaling”占比过半 Error in grDevices::pdf(NULL, width = width, height = height) : Graphics API version mismatch 什么问题

这个错误可能是由于您使用的R版本与绘图设备(grDevices)包中使用的图形API版本不兼容导致的。您可以尝试以下解决方法：

1. 确保您的R版本和绘图设备包(grDevices)是最新的。可以尝试更新R版本和相应的包，然后再次运行代码。

2. 如果您已经使用最新版本的R和绘图设备包，但仍然遇到此错误，请尝试重新安装绘图设备包。可以使用以下命令从CRAN重新安装grDevices包：

install.packages("grDevices")

3. 如果以上方法仍然无效，您可以尝试使用其他绘图设备或图形输出格式来保存图像，例如使用png()函数来保存为PNG格式：

png("plot.png", width = 800, height = 600)
showDatabaseCategory(CellChatDB)
dev.off()

希望这些解决方法能够帮助您解决问题。如果问题仍然存在，请提供更多的错误信息和上下文，以便我们能够更好地帮助您。

showDatabaseCategory(CellChatDB) #作 者提供了可视化的代码，可以看到该数据库中“Secreted Signaling”占比过半 Error in grDevices::pdf(NULL, width = width, height = height) : Graphics API version mismatch 怎么解决

您遇到的错误是由于图形设备的API版本不匹配导致的。要解决此问题，您可以尝试以下几种方法：

1. 更新R和相关的包：确保您使用的是最新版本的R和相关的包。您可以尝试运行以下代码来更新包：

update.packages(ask = FALSE, checkBuilt = TRUE)

2. 检查图形设备：运行以下代码来检查和设置正确的图形设备：

capabilities()

确保图形设备正常工作，并且没有冲突。

3. 重新安装图形设备驱动程序：如果图形设备驱动程序有问题，您可以尝试重新安装或更新它们。

如果上述方法仍然无法解决问题，建议您提供更多详细信息，例如操作系统、R版本以及完整的错误消息，以便我们能够更好地帮助您解决问题。