ggplot绘制森林图
时间: 2024-10-07 11:02:49 浏览: 42
森林图_R语言绘制SCI图的输入文件及代码.rar
ggplot2是一个基于R语言的强大数据可视化包,特别适合于制作统计图形。在ggplot2中,要绘制森林图(也称为层次聚类图),你可以使用`geom_tree()`函数。首先,你需要安装`ggraph`和`tidytree`这两个拓展包来处理更复杂的树形结构。
以下是基本步骤:
1. 准备数据:数据应该包含节点信息,比如父节点ID、节点名称或值、以及每个节点的高度或其他可视化属性。
```R
library(tidytree)
library(ggplot2)
library(ggraph)
# 假设你有一个数据框df,其中包含节点和其父节点
```
2. 将数据转换为tidytree格式:
```R
df_tree <- df %>% nest() %>%
mutate(node = map(data, ~as.tidytree(.x, node_name = "name", parent = "parent")))
```
3. 绘制森林图:
```R
ggplot(df_tree, aes(x = label, y = height, group = node)) +
geom_tree(orientation = "h") +
theme_graph() +
labs(title = "Forest Plot")
```
这将创建一个垂直的森林图,其中每个树的分支长度表示节点之间的距离。
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