编写随机森林R代码对是否患病进行分类预测,包括数据预处理、模型训练、预测、ROC曲线绘制等步骤。其中,使用了tidyverse、skimr、caret、pROC、randomForest、ggplot和nnet等R语言包。。
时间: 2023-12-28 16:17:45 浏览: 154
以下是随机森林R代码对是否患病进行分类预测的一个示例:
首先,我们需要安装并加载需要的R语言包:
```R
install.packages(c("tidyverse", "skimr", "caret", "pROC", "randomForest", "ggplot2", "nnet"))
library(tidyverse)
library(skimr)
library(caret)
library(pROC)
library(randomForest)
library(ggplot2)
library(nnet)
```
接着,我们需要读入数据并进行预处理,包括数据清洗、变量选择和数据分割等步骤:
```R
# 读入数据
data <- read.csv("data.csv")
# 数据清洗
data <- na.omit(data) # 删除缺失值
# 变量选择
vars <- c("age", "gender", "blood_pressure", "cholesterol", "glucose", "smoking", "alcohol", "exercise", "disease") # 选择需要的变量
data <- data[, vars]
# 数据分割
set.seed(123) # 设置种子,确保可重复性
train_index <- createDataPartition(data$disease, p = 0.7, list = FALSE) # 将数据划分为训练集和测试集
train_data <- data[train_index, ]
test_data <- data[-train_index, ]
```
接下来,我们可以使用随机森林算法训练模型,并进行预测:
```R
# 训练模型
model <- randomForest(disease ~ ., data = train_data, ntree = 500, mtry = 3)
# 预测
pred <- predict(model, newdata = test_data)
```
最后,我们可以绘制ROC曲线,评估模型的性能:
```R
# 绘制ROC曲线
roc <- roc(test_data$disease, pred)
plot(roc, print.thres = c(0.1, 0.5, 0.9), main = "ROC Curve for Random Forest Model")
```
以上就是一个简单的随机森林R代码对是否患病进行分类预测的示例。需要注意的是,这只是一个示例,实际应用中还需要根据具体数据和问题进行调整和优化。
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