怎么让shap_values的返回二维数组
时间: 2024-09-28 09:07:29 浏览: 70
`shap_values`通常是指Shapley Additive Explanations (SHAP)库中用于解释模型预测的重要性的值。当你想要将`shap_values`从模型的解释结果转换为二维数组时,它通常表示每个特征对模型预测影响的加权平均。以下是一个简单的步骤:
1. **模型解释**:首先,你需要获取到模型的`shap_values`,这通常是基于每个样本的预测。
```python
explainer = shap.TreeExplainer(model)
shap_values = explainer.shap_values(X_test)
```
这里的`X_test`是待解释的数据集,`model`是训练好的模型。
2. **转换形状**:默认情况下,`shap_values`可能是三维数组,第一维对应于样本,第二维对应于特征,第三维是SHAP值。如果你想要将其展平成二维,可以使用`numpy`库的`reshape`函数:
```python
reshaped_shap_values = shap_values.reshape(-1, shap_values.shape[-1])
```
`-1`会让`reshape`自动计算第一维的大小,保证总元素不变。
3. **二维数组**:现在,`reshaped_shap_values`就是你想要的一维特征对应的SHAP值的二维数组了。
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解释以下代码shap_values = np.zeros(541320) for fold in range(0, 5): x = train_x_list[fold] model = models[fold] explainer = shap.TreeExplainer(model) shap_value = explainer(x) print(f"shap_value.shape:{shap_value.shape}") # shap_values.append(shap_value) tmp = np.concatenate([i.values for i in shap_value]) ### maxSize = tmp.size if tmp.size>shap_values.size else shap_values.size ### tmp.resize(maxSize) ### shap_values.resize(maxSize) print(f"{fold}th size: {tmp.size}") shap_values = np.add(shap_values, tmp) from functools import reduce #shap_value_5_fold = np.concatenate([i.values for i in shap_values]) ##看shap值是否服从正态分布,若服从则不用取均值 #shap_value_5_fold /= 5 shap_values[:] = [x / 5 for x in shap_values] shap_values = shap_values.reshape(260, 2082)
这段代码是用来计算基于决策树的 SHAP 值的。SHAP 值是一种用于解释模型预测的技术,它可以告诉我们每个特征对于模型预测的贡献程度。在这段代码中,首先创建了一个全为零的数组 shap_values,用于存储每个特征的 SHAP 值。然后通过一个循环来遍历训练集的每个 fold,从而计算出每个 fold 的 SHAP 值。在计算过程中,使用了 shap.TreeExplainer 方法来创建一个 SHAP 值的解释器,然后将训练集的输入数据 x 作为输入,得到一个 SHAP 值的输出 shap_value。接下来,将每个 fold 的 SHAP 值转换成一个一维数组 tmp,并将其与 shap_values 数组进行拼接。在拼接之前,需要将两个数组的大小都调整为相同大小,以避免出现大小不匹配的问题。最后,将 shap_values 数组中每个元素都除以 5,得到每个特征的平均 SHAP 值,并将数组重新调整为一个二维数组。
# 将shap_values数组转换为二维数组 shap_values_2d = np.reshape(shap_values, (len(shap_values), -1)) # 将testX数组转换为二维数组 testX_2d = np.reshape(testX, (len(testX), -1)) shap.initjs() shap.force_plot(explainer.expected_value, shap_values_2d[:] ,testX_2d[:],feature_names=['gonglv', 'fengsu100', 'fengxiang100','qiwen','qiya','fengsu170','fengxiang170','fengsu30','fengxiang30','fengsu10','fengxiang10','shidu']) shap.plots.waterfall(explainer.expected_value,shap_values_2d[0])代码运行后没有图片显示也没有报错是怎么回事
如果代码没有报错,但是没有生成可解释图,可能是因为缺少必要的前端资源或者JavaScript运行环境没有正常加载。你可以尝试在代码运行之前手动加载必要的前端资源,例如:
```python
import IPython
display(IPython.core.display.HTML('<script src="/static/components/requirejs/require.js"></script>'))
```
这个代码片段会在Notebook中加载必要的前端资源。如果你在PyCharm中运行代码,可能需要找到类似的JavaScript文件并手动加载。你可以在shap库的官方文档中查找相关信息,以确定代码中需要加载哪些前端资源。
此外,如果你的特征数量比较多,可能会导致可解释图显示不完整或者过于拥挤。你可以尝试使用`matplotlib`库来调整可解释图的大小和布局,例如修改`shap.force_plot`和`shap.plots.waterfall`方法的`matplotlib=True`选项,或者使用`plt.subplots_adjust`函数来调整子图的布局。
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