def calc_diff_map(dist_mat, dims=2, factor=2): sigma = numpy.median(dist_mat)/factor diff_kernal = numpy.exp(-(dist_mat ** 2) / (2 * sigma ** 2)) row_sum = numpy.sum(diff_kernal, axis=1) normlized_kernal = numpy.dot(numpy.diag(1 / row_sum), diff_kernal) U, S, V = numpy.linalg.svd(normlized_kernal) return U[:, 1:dims+1].T转matlab
时间: 2024-04-11 16:29:11 浏览: 218
在 MATLAB 中,你可以使用以下代码将给定的 Python 函数 `calc_diff_map` 转换为 MATLAB 语法:
```matlab
function U = calc_diff_map(dist_mat, dims, factor)
sigma = median(dist_mat(:)) / factor;
diff_kernel = exp(-(dist_mat .^ 2) / (2 * sigma ^ 2));
row_sum = sum(diff_kernel, 2);
normalized_kernel = (1 ./ row_sum) .* diff_kernel;
[U, ~, ~] = svd(normalized_kernel);
U = U(:, 1:dims)';
end
```
在 MATLAB 中,函数定义使用 `function` 关键字,并且在函数名称后面跟上输入参数。在这个例子中,输入参数包括 `dist_mat`(距离矩阵)、`dims`(维度)和 `factor`(因子)。使用 `:` 运算符将 `dist_mat` 转换为向量,并使用 `median` 函数计算中位数。使用 `exp` 函数计算指数,使用 `sum` 函数计算行和。通过逐元素除法和点乘运算来计算归一化的核矩阵。函数 `svd` 返回的第一个输出参数是特征向量矩阵 `U`,我们选择其中的前 `dims` 列,并将其转置以匹配 Python 版本的输出格式。最后,返回结果矩阵 `U`。
相关问题
根据本关所学知识,完成calc_min_dist函数,calc_max_dist函数以及calc_avg_dist函数分别实现计算两个簇之间的最短距离、最远距离和平均距离。
在Python中,特别是在处理数据集和机器学习任务中,我们可能会遇到需要计算簇间相似度的情况。这里,我们需要编写三个函数:`calc_min_dist`,`calc_max_dist`,和`calc_avg_dist`,它们分别用于计算两个簇(假设是数组形式)的最短距离、最长距离和平均距离。
首先,你需要导入必要的库,如`numpy`,它提供了一系列数值计算的功能:
```python
import numpy as np
```
然后,我们可以定义这三个函数:
1. **`calc_min_dist(cluster1, cluster2)`** 计算两个簇之间最小距离
```python
def calc_min_dist(cluster1, cluster2):
return np.min(np.sqrt(((cluster1[:, np.newaxis, :] - cluster2)**2).sum(axis=2)))
```
这里使用了numpy的广播功能来计算每个点对间的距离,并取最小值。
2. **`calc_max_dist(cluster1, cluster2)`** 计算两个簇之间最大距离
```python
def calc_max_dist(cluster1, cluster2):
return np.max(np.sqrt(((cluster1[:, np.newaxis, :] - cluster2)**2).sum(axis=2)))
```
同样,这里是求最大值。
3. **`calc_avg_dist(cluster1, cluster2)`** 计算两个簇之间平均距离
```python
def calc_avg_dist(cluster1, cluster2):
distances = np.sqrt(((cluster1[:, np.newaxis, :] - cluster2)**2).sum(axis=2))
return np.mean(distances)
```
这里计算所有点对的距离并返回平均值。
请注意,上述函数假设输入的`cluster1`和`cluster2`都是二维数组,每行代表一个点,且每个簇有相同的维度。
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