减小nii数据的像素大小python
时间: 2023-08-11 15:26:26 浏览: 153
可以使用SimpleITK库中的Resample函数来减小nii数据的像素大小,具体实现步骤如下:
1. 首先导入SimpleITK库
```python
import SimpleITK as sitk
```
2. 加载需要处理的nii数据
```python
image = sitk.ReadImage("image.nii")
```
3. 获取原始图像的像素尺寸和大小
```python
size = image.GetSize()
spacing = image.GetSpacing()
```
4. 计算新的像素尺寸和大小
```python
new_spacing = [spacing[0]*2, spacing[1]*2, spacing[2]*2] # 新的像素尺寸
new_size = [int(size[0]/2), int(size[1]/2), int(size[2]/2)] # 新的像素大小
```
5. 调用Resample函数对图像进行重采样
```python
resample = sitk.Resample(image, new_size, sitk.Transform(), sitk.sitkLinear, image.GetOrigin(), new_spacing, image.GetDirection(), 0.0, image.GetPixelIDValue())
```
6. 将处理后的图像保存
```python
sitk.WriteImage(resample, "resample_image.nii")
```
其中,Resample函数的参数分别为:需要重采样的原始图像、新的像素大小、变换、插值方法、原点、新的像素尺寸、方向、填充值和像素类型。上述代码将原始图像的像素大小减小了一半。
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