写一段python代码例子,用reslice处理本地nii文件
时间: 2024-05-02 08:22:18 浏览: 144
python 读取.nii格式图像实例
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以下是一个Python代码示例,使用reslice处理本地NII文件:
```python
import nibabel as nib
import numpy as np
# 读取NII文件
nii_file = nib.load('example.nii')
nii_data = nii_file.get_fdata()
nii_affine = nii_file.affine
# 将数据重采样为1x1x1mm的分辨率
new_shape = (int(nii_data.shape[0]*nii_affine[0,0]), int(nii_data.shape[1]*nii_affine[1,1]), int(nii_data.shape[2]*nii_affine[2,2]))
new_affine = np.array([[1.0, 0, 0, 0], [0, 1.0, 0, 0], [0, 0, 1.0, 0], [0, 0, 0, 1.0]])
resliced_data = nib.processing.resample_to_output(nii_data, new_shape, new_affine)
# 将重采样后的数据保存为NII文件
resliced_nii = nib.Nifti1Image(resliced_data, new_affine)
nib.save(resliced_nii, 'example_resliced.nii')
```
这个示例代码使用了nibabel库来读取和保存NII文件,并使用nibabel的resample_to_output函数将数据重采样为1x1x1mm的分辨率。重采样后的数据保存为新的NII文件。
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