means = np.random.rand(num_clusters, data.shape[1])这里的data.shape[1]什么意思
时间: 2023-12-24 13:05:40 浏览: 36
在这个代码段中,`data`是一个矩阵,其中每一行是一个数据点,每列是该数据点的一个特征。例如,如果我们有100个数据点,每个数据点有3个特征,那么`data`的形状将是`(100, 3)`。因此,`data.shape[1]`表示`data`矩阵中每个数据点的特征数量。`num_clusters`是聚类算法中的聚类数量,因此`means`是一个形状为`(num_clusters, data.shape[1])`的随机矩阵,其中每行表示一个聚类的中心点,每列表示该聚类中心点的不同特征的值。
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def fuzzy_kmeans(data, num_clusters, m, max_iter=100, epsilon=1e-4): num_samples = data.shape[0] num_features = data.shape[1] # 初始化隶属度矩阵 membership = np.random.dirichlet(np.ones(num_clusters), size=num_samples) # 迭代更新聚类中心和隶属度 for iter in range(max_iter): # 计算聚类中心 centers = np.zeros((num_clusters, num_features)) for k in range(num_clusters): centers[k] = np.sum((membership[:, k]**m).reshape(-1, 1) * data, axis=0) / np.sum(membership[:, k]**m) # 计算隶属度 new_membership = np.zeros((num_samples, num_clusters)) for i in range(num_samples): for k in range(num_clusters): numerator = np.linalg.norm(data[i] - centers[k]) denominator = np.sum([(np.linalg.norm(data[i] - centers[j]) / numerator)**(2 / (m - 1)) for j in range(num_clusters)]) new_membership[i, k] = 1 / denominator # 判断迭代终止条件 if np.sum(np.abs(new_membership - membership)) < epsilon: break membership = new_membership return centers, membership
这是一个模糊k-means聚类算法的Python实现。该算法使用隶属度矩阵来描述每个数据点属于每个聚类中心的隶属度程度。具体步骤如下:
1. 初始化隶属度矩阵,使用Dirichlet分布生成每个数据点属于每个聚类中心的隶属度。
2. 迭代更新聚类中心和隶属度,直到达到迭代终止条件。在每次迭代中,计算聚类中心和每个数据点属于每个聚类中心的隶属度。
3. 计算聚类中心,对于每个聚类中心,计算其对应的数据点在隶属度矩阵上的加权平均值。
4. 计算隶属度,对于每个数据点和每个聚类中心,计算其隶属度,使用公式:$u_{ik} = \frac{1}{\sum_{j=1}^c(\frac{d_{ik}}{d_{ij}})^{\frac{2}{m-1}}}$,其中 $d_{ik}$ 表示数据点 $i$ 与聚类中心 $k$ 的距离,$d_{ij}$ 表示数据点 $i$ 与聚类中心 $j$ 的距离。
5. 判断迭代终止条件,如果当前隶属度矩阵与上一次迭代的隶属度矩阵的差异小于给定的阈值,则停止迭代。
6. 返回计算得到的聚类中心和隶属度矩阵。
from sklearn.decomposition import PCA from sklearn.cluster import KMeans from sklearn.metrics import accuracy_score import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from tensorflow.examples.tutorials.mnist import input_data import datetime # 导入数据集 start = datetime.datetime.now() #计算程序运行时间 mnist = input_data.read_data_sets("MNIST_data/", one_hot=True) X_train = mnist.train.images y_train = mnist.train.labels X_test = mnist.test.images y_test = mnist.test.labels #PCA降维 pca = PCA(n_components=10) X_train_pca = pca.fit_transform(X_train) X_test_pca = pca.fit_transform(X_test) # 可视化 plt.scatter(X_train_pca[:, 0], X_train_pca[:, 1], c=np.argmax(y_train, axis=1)) plt.show() # K-means聚类 kmeans_centers = [] # 用于存储初始类中心 for i in range(10): idx = np.where(np.argmax(y_train, axis=1) == i)[0] # 获取第i类数字的索引列表 sample_idx = np.random.choice(idx) # 随机指定一个样本作为初始类中心 kmeans_centers.append(X_train_pca[sample_idx]) # 将初始类中心添加到列表中 kmeans = KMeans(n_clusters=10,init=kmeans_centers,n_init=1) kmeans.fit(X_train_pca) # 计算分类错误率 y_pred = kmeans.predict(X_test_pca) acc = accuracy_score(np.argmax(y_test, axis=1), y_pred) print("分类错误率:{:.2%}".format(1-acc)) # 计算程序运行时间 end = datetime.datetime.now() print("程序运行时间为:"+str((end-start).seconds)+"秒")优化这段代码,输出其中pca降维的因子负荷量
可以优化代码如下:
```
from sklearn.decomposition import PCA
from sklearn.cluster import KMeans
from sklearn.metrics import accuracy_score
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from tensorflow.examples.tutorials.mnist import input_data
import datetime
# 导入数据集
start = datetime.datetime.now() #计算程序运行时间
mnist = input_data.read_data_sets("MNIST_data/", one_hot=True)
X_train = mnist.train.images
y_train = mnist.train.labels
X_test = mnist.test.images
y_test = mnist.test.labels
# PCA降维
pca = PCA(n_components=10)
X_train_pca = pca.fit_transform(X_train)
X_test_pca = pca.transform(X_test)
# 输出因子负荷量
print("PCA降维后的因子负荷量为:")
print(pca.components_)
# 可视化
plt.scatter(X_train_pca[:, 0], X_train_pca[:, 1], c=np.argmax(y_train, axis=1))
plt.show()
# K-means聚类
kmeans_centers = []
# 用于存储初始类中心
for i in range(10):
idx = np.where(np.argmax(y_train, axis=1) == i)[0] # 获取第i类数字的索引列表
sample_idx = np.random.choice(idx) # 随机指定一个样本作为初始类中心
kmeans_centers.append(X_train_pca[sample_idx]) # 将初始类中心添加到列表中
kmeans = KMeans(n_clusters=10,init=kmeans_centers,n_init=1)
kmeans.fit(X_train_pca)
# 计算分类错误率
y_pred = kmeans.predict(X_test_pca)
acc = accuracy_score(np.argmax(y_test, axis=1), y_pred)
print("分类错误率:{:.2%}".format(1-acc))
# 计算程序运行时间
end = datetime.datetime.now()
print("程序运行时间为:"+str((end-start).seconds)+"秒")
```
输出结果中包含了PCA降维后的因子负荷量,即`pca.components_`。