用opencv结合层次分水岭和细胞计数并在图上标记细胞数字,写出具体代码

时间: 2024-03-23 15:39:48 浏览: 16
好的,以下是一个简单的用OpenCV实现细胞计数并标记的代码,主要使用了层次分水岭算法和形态学操作: ```python import cv2 import numpy as np # 读入图像并转为灰度图 img = cv2.imread('cells.jpg') gray = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_BGR2GRAY) # 高斯模糊去噪声 blur = cv2.GaussianBlur(gray, (5, 5), 0) # Sobel算子求梯度 grad_x = cv2.Sobel(blur, cv2.CV_32F, 1, 0, ksize=3) grad_y = cv2.Sobel(blur, cv2.CV_32F, 0, 1, ksize=3) grad = cv2.subtract(grad_x, grad_y) grad = cv2.convertScaleAbs(grad) # 形态学操作,闭运算 kernel = cv2.getStructuringElement(cv2.MORPH_RECT, (9, 9)) closed = cv2.morphologyEx(grad, cv2.MORPH_CLOSE, kernel) # 膨胀操作,放大细胞 kernel = cv2.getStructuringElement(cv2.MORPH_RECT, (21, 21)) dilation = cv2.dilate(closed, kernel) # 距离变换,寻找分水岭中的种子点 dist_transform = cv2.distanceTransform(dilation, cv2.DIST_L2, 5) ret, sure_fg = cv2.threshold(dist_transform, 0.5 * dist_transform.max(), 255, 0) sure_fg = np.uint8(sure_fg) # 执行分水岭算法 unknown = cv2.subtract(sure_bg, sure_fg) ret, markers = cv2.connectedComponents(sure_fg) markers = markers + 1 markers[unknown == 255] = 0 markers = cv2.watershed(img, markers) # 标记并显示细胞数量 cells_num = len(np.unique(markers)) - 1 cv2.putText(img, f'Cells: {cells_num}', (30, 50), cv2.FONT_HERSHEY_SIMPLEX, 1, (0, 0, 255), 2) cv2.imshow('Result', img) cv2.waitKey(0) cv2.destroyAllWindows() ``` 需要注意的是,以上代码只适用于特定的图像,可能需要根据实际情况进行调整。

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