freesurfer怎么提取每个顶点的值

在FreeSurfer中，可以使用mri_surf2vol工具将表面数据映射到体积数据上，然后使用mri_extract_surf工具提取每个顶点的值。

具体步骤如下：

1. 将表面数据（如lh.white）映射到体积数据（如mri/T1.mgz）上，生成体积数据（如lh.white.mgz）：

   mri_surf2vol --surfval lh.white --hemi lh --fillribbon --identity --o lh.white.mgz --subject <subject_id> --template mri/T1.mgz

2. 提取每个顶点的值（如thickness）：

   mri_extract_surf -mgh lh.thickness.mgh -surf lh.white -fsgd <fsgd_file> -o <output_file>

其中，<fsgd_file>是FreeSurfer Group Descriptor文件，用于指定组别信息，<output_file>是输出文件名。

此外，您还可以使用FreeSurfer中的其他工具来提取每个顶点的值，如mris_anatomical_stats和mris_make_surfaces。具体使用方法可以参考FreeSurfer官方文档。