在ubuntu16.04系统x86架构下，使用clion编译程序，调用了pcl1.7和vtk6.2以及eigen3库，如何在x86系统下编译完成arm程序，以及如何编译arm的第三方库以供使用，详细说明流程和方法，以及操作步骤。

编译程序在不同的架构下需要使用不同的编译器和工具链。在这里，我们需要使用arm-linux-gnueabihf-g++编译器和相应的工具链来编译arm程序。

步骤如下：

1. 安装arm-linux-gnueabihf-g++编译器和工具链：

sudo apt-get install gcc-arm-linux-gnueabihf g++-arm-linux-gnueabihf

2. 设置环境变量：

export CC=arm-linux-gnueabihf-gcc
export CXX=arm-linux-gnueabihf-g++

3. 在CLion中添加新的编译器：

打开CLion，进入Settings -> Build, Execution, Deployment -> Toolchains，点击“+”按钮，添加一个新的编译器，选择“Remote Host”，填写以下信息：

- Name：arm-linux-gnueabihf
- Host：填写目标设备的IP地址
- Port：填写目标设备的SSH端口号，默认为22
- Username：填写目标设备的用户名
- Authentication type：选择“Key pair”，并选择你在目标设备中生成的SSH密钥
- Remote path：填写目标设备上的远程路径，例如“/usr/arm-linux-gnueabihf/”

4. 在CLion中配置CMake：

打开CLion，进入Settings -> Build, Execution, Deployment -> CMake，选择“Profile: arm-linux-gnueabihf”，并在“CMake options”中添加以下内容：

-DCMAKE_TOOLCHAIN_FILE=/usr/arm-linux-gnueabihf/share/cmake/Modules/Platform/ARM-linux-gnueabihf.cmake

这将告诉CMake使用arm-linux-gnueabihf编译器和工具链来编译程序。

5. 编译程序：

在CLion中选择“Build -> Build Project”，或者使用快捷键“Ctrl+F9”，CLion将使用arm-linux-gnueabihf编译器和工具链来编译程序，生成ARM可执行文件。

6. 编译ARM的第三方库：

编译ARM的第三方库需要使用相应的交叉编译工具链。以PCL为例，使用以下命令来编译ARM版本的PCL：

mkdir build-arm
cd build-arm
cmake -DCMAKE_TOOLCHAIN_FILE=/usr/arm-linux-gnueabihf/share/cmake/Modules/Platform/ARM-linux-gnueabihf.cmake ..
make

这将使用arm-linux-gnueabihf编译器和工具链来编译ARM版本的PCL库。

7. 将ARM程序和第三方库部署到目标设备：

将编译好的ARM程序和第三方库复制到目标设备上，运行ARM程序即可。

希望这些步骤能够帮助你成功地在x86系统下编译完成ARM程序，并编译ARM的第三方库以供使用。