Survival包中的coxph函数做完Cox回归后,如何做nomogram
时间: 2024-10-27 20:10:19 浏览: 32
生存分析的cox回归模型案例——spss.pdf
在R语言的Survival包中,`coxph()`函数用于执行 Cox 单变量或变量筛选后的比例风险模型(Cox回归)。完成Cox回归后,如果你想要创建一个 nomogram (生存概率图),可以借助`rms`包中的`nomogram()`函数。以下是基本步骤:
1. 首先,确保已经安装了`rms`包,如果没有,可以运行 `install.packages("rms")`。
2. 导入之前用`coxph()`分析得到的结果,比如叫`fit`的对象:
```r
library(rms)
fit <- coxph(Surv(time, status) ~ variable1 + variable2 + ..., data = your_data)
```
3. 使用`rms`包创建nomogram:
```r
nomogram(fit)
```
这将显示一个交互式的图形,你可以通过滚动鼠标或滑动条查看不同变量对生存率的影响以及组合效应。
4. 如果需要保存为图片,可以添加`plot()`, 并指定文件名:
```r
plot(nomogram(fit), main="YourNomogramTitle", file="path/to/save/nomogram.png")
```
5. 可能还需要调整nomogram的一些设置,例如刻度、标题等,可以查阅`nomogram()`的帮助文档了解详细选项。
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