怎么解决WARNING: CGenFF versions are not equivalent! ERROR: Could not detect CGenFF version. Exiting.
时间: 2024-04-21 21:24:28 浏览: 19
要解决 "WARNING: CGenFF versions are not equivalent!" 和 "ERROR: Could not detect CGenFF version. Exiting." 这两个错误,您可以尝试以下步骤:
1. 检查CGenFF版本:首先,请确保您已正确安装了CGenFF,并且版本是正确的。您可以通过运行 `cgenff_charmm2gmx.py -v` 命令来检查CGenFF的版本。确保您使用的CGenFF版本与脚本要求的版本兼容。
2. 检查CGenFF文件路径:确保您已正确设置了CGenFF文件的路径。在运行脚本时,通常会使用环境变量或指定CGenFF文件所在的文件夹路径。确保这些设置是正确的,并且脚本能够找到所需的CGenFF文件。
3. 更新CGenFF文件:如果您使用的CGenFF文件版本与脚本要求的版本不兼容,尝试更新到与脚本兼容的CGenFF版本。您可以从CGenFF官方网站或相关资源中获取最新的CGenFF文件,并替换掉旧版本。
4. 与CGenFF开发者联系:如果上述步骤都没有解决问题,您可以尝试联系CGenFF的开发者或访问相关的支持论坛,以获取更多关于该错误的帮助和指导。
请注意,CGenFF是一个第三方工具,我无法提供详细的技术支持。以上步骤提供了一般的解决方案,具体解决方法可能因您的环境和配置而有所不同。
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在cmd中运行python cgenff_charmm2gmx.py JZ4 jz4_fix.mol2 jz4.str charmm36-jul2022.ff出现错误WARNING: CGenFF versions are not equivalent! ERROR: Could not detect CGenFF version. Exiting.怎么解决
这个错误提示表明在运行 `cgenff_charmm2gmx.py` 脚本时,未能检测到CGenFF版本。要解决这个问题,您可以尝试以下几个步骤:
1. 确认CGenFF版本:首先,确保您已经正确安装了CGenFF,并且版本是正确的。您可以通过在命令行中输入 `cgenff_charmm2gmx.py -v` 来检查CGenFF的版本。确保您使用的CGenFF版本与脚本要求的版本兼容。
2. 更新脚本:如果您的CGenFF版本与脚本要求的版本不兼容,可以尝试更新 `cgenff_charmm2gmx.py` 脚本,以确保它与您所使用的CGenFF版本匹配。您可以从相应的来源(例如GitHub)获取最新的脚本版本,并替换掉旧版本。
3. 检查CGenFF路径:确认您已正确设置了CGenFF的路径。在脚本中,通常会使用环境变量或指定CGenFF所在的文件夹路径。确保这些设置是正确的,并且脚本能够找到CGenFF所需的文件。
4. 与CGenFF开发者联系:如果上述步骤都没有解决问题,您可以尝试联系CGenFF的开发者或访问相关的支持论坛,以获取更多关于该错误的帮助和指导。
请注意,CGenFF是一个第三方工具,我无法提供详细的技术支持。以上步骤仅提供一般的解决方案,具体解决方法可能因您的环境和配置而有所不同。
翻译NOTE 1: Code tested with Python 3.5.2 and 3.7.3. Your version: 3.8.2 (tags/v3.8.2:7b3ab59, Feb 25 2020, 23:03:10) [MSC v.1916 64 bit (AMD64)] NOTE 2: Code tested with NetworkX 2.3. Your version: 2.3 NOTE 3: Please be sure to use the same version of CGenFF in your simulations that was used during parameter generation: --Version of CGenFF detected in charmm36-jul2022.ff/forcefield.doc : 4.6 WARNING: CGenFF versions are not equivalent! ERROR: Could not detect CGenFF version. Exiting.
注意 1: 代码已在Python 3.5.2和3.7.3上进行测试。您的版本是:3.8.2(tags/v3.8.2:7b3ab59, Feb 25 2020, 23:03:10)[MSC v.1916 64 bit (AMD64)]
注意 2: 代码已在NetworkX 2.3上进行测试。您的版本是:2.3
注意 3: 请确保在模拟中使用与参数生成期间使用的相同版本的CGenFF:
- 在 charmm36-jul2022.ff/forcefield.doc 中检测到的CGenFF版本为 4.6
警告: CGenFF 版本不一致!
错误: 无法检测到 CGenFF 版本。程序退出。