python实现将nii.gz格式的T1和T1ce模态数据转换为numpy数组进行做差得到sub,再将numpy数组的sub转换成nii.gz格式的数据
时间: 2023-11-27 17:52:34 浏览: 142
可以使用Python中的nibabel库来读取和写入nii.gz格式的数据,使用numpy库进行数组操作。
首先,需要安装nibabel库和numpy库:
```
pip install nibabel
pip install numpy
```
接下来,可以按照以下步骤来实现将nii.gz格式的T1和T1ce模态数据转换为numpy数组进行做差得到sub,再将numpy数组的sub转换成nii.gz格式的数据:
1. 导入nibabel库和numpy库:
```
import nibabel as nib
import numpy as np
```
2. 使用nibabel库的load函数来读取T1和T1ce模态数据:
```
t1_img = nib.load('t1.nii.gz')
t1ce_img = nib.load('t1ce.nii.gz')
```
3. 使用nibabel库的get_fdata函数将nii.gz格式的数据转换为numpy数组:
```
t1_data = t1_img.get_fdata()
t1ce_data = t1ce_img.get_fdata()
```
4. 对T1和T1ce模态数据的numpy数组进行做差操作得到sub:
```
sub_data = t1_data - t1ce_data
```
5. 使用nibabel库的Nifti1Image函数将sub的numpy数组转换为nii.gz格式的数据:
```
sub_img = nib.Nifti1Image(sub_data, t1_img.affine)
```
6. 使用nibabel库的save函数将sub的nii.gz格式数据保存到文件:
```
nib.save(sub_img, 'sub.nii.gz')
```
通过以上步骤,就可以实现将nii.gz格式的T1和T1ce模态数据转换为numpy数组进行做差得到sub,再将numpy数组的sub转换成nii.gz格式的数据。
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