用shell脚本实现:文件夹region_174364中有42个文件,名为ROI1,ROI2...ROI42,对这42个文件两两组合,进行tckedit UKF2T.tck Confile1_file2.tck file1 file2的操作,并将生成的Confile1_file2文件使用tckinfo指令写入一个txt中,遍历所有组合生成的txt文件最终组成一个42×42的numpy矩阵,file1_file2的数值对应矩阵下标。 例如对ROI1和ROI2执行tckedit指令,生成Con1_2.tck,写入Con1_2.txt中,1_2也是其在矩阵中的位置,即Con1_2.txt中存储的纤维数量的值对应处于第一行第二列。
时间: 2023-12-14 16:39:09 浏览: 59
以下是一个可能的实现方式:
```bash
#!/bin/bash
# 定义文件夹路径
folder="region_174364"
# 定义UKF2T.tck文件路径
ukf_file="UKF2T.tck"
# 定义矩阵文件路径
matrix_file="matrix.txt"
# 初始化矩阵文件,全部填充为0
rm -f "$matrix_file"
for ((i=1; i<=42; i++)); do
for ((j=1; j<=42; j++)); do
echo -n "0 " >> "$matrix_file"
done
echo "" >> "$matrix_file"
done
# 遍历文件夹中的所有文件,两两组合
for ((i=1; i<=41; i++)); do
for ((j=i+1; j<=42; j++)); do
# 定义文件名
file1="ROI$i"
file2="ROI$j"
con_file="Con${i}_${j}.tck"
info_file="Con${i}_${j}.txt"
# 执行tckedit指令
tckedit "$ukf_file" "$con_file" "$folder/$file1" "$folder/$file2"
# 使用tckinfo指令获取纤维数量,并写入txt文件
tckinfo "$con_file" | grep "count:" | awk '{print $2}' > "$info_file"
# 将txt文件中的值写入矩阵中对应的位置
index=$((i*42+j-j*(j+1)/2))
value=$(cat "$info_file")
sed -i "${index}s/0/$value/" "$matrix_file"
# 删除生成的文件
rm -f "$con_file" "$info_file"
done
done
```
这个脚本会遍历文件夹中的所有文件,两两组合,执行tckedit和tckinfo指令,并将结果写入矩阵文件中。矩阵文件的每一行和每一列都对应着一个文件,文件名为ROI后面的数字。例如,第一行第二列对应着ROI1和ROI2的组合,生成的txt文件里的值就会写入矩阵文件的第一行第二列。最终生成的矩阵文件是一个42×42的矩阵,每个值对应着两个文件的组合。
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