freesurfer如何在manjaro中安装

Freesurfer是一种广泛用于神经影像分析的开源软件套件，它包含了各种工具用于处理、分割大脑MRI数据。要在Manjaro Linux（基于Arch的发行版）上安装Freesurfer，你可以按照以下步骤操作：

更新包列表：
sudo pacman -Syu
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安装必要的依赖：
sudo pacman -S base-devel git cmake atlas lcms2 libpng freetype harfbuzz libtiff libjpeg openblas lapack blas-devel
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获取Freesurfer源码：
git clone https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/Freesurfer.git freesurfer
cd freesurfer
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配置安装：
./autogen.sh && ./configure --prefix=/usr/local/freesurfer
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编译并安装：
make all
sudo make install
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初始化环境变量：
将Freesurfer添加到环境变量中，通常是在~/.bashrc或~/.zshrc文件中追加以下内容：
export FREESURFER_HOME=/usr/local/freesurfer
export PATH=$PATH:$FREESURFER_HOME/bin
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最后运行初始化脚本：
source ~/.bashrc
rehash
init-recon-all
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注意：这是一般的安装步骤，实际过程中可能会因为版本差异或系统特定问题需要调整。安装完成后，记得检查是否一切正常，如通过运行recon-all -h测试命令。