R语言 如何绘制库克距离热图

绘制库克距离热图可以使用R语言中的`pheatmap`函数。`pheatmap`函数可以根据输入的矩阵生成热图，其中每个单元格的颜色表示对应位置的数值大小。

以下是一个简单的示例代码来绘制库克距离热图：

# 首先，需要安装和加载pheatmap包
install.packages("pheatmap")
library(pheatmap)

# 建立一个包含10个样本的数据框
data <- matrix(rnorm(100), ncol = 10)

# 计算库克距离
d <- dist(data, method = "euclidean")

# 将距离矩阵转换为矩阵格式
m <- as.matrix(d)

# 绘制热图
pheatmap(m, scale = "none", clustering_distance_rows = d, clustering_distance_cols = d)

在上面的代码中，我们首先生成一个包含10个样本的随机数据框。然后，我们使用`dist`函数计算数据框中每对样本之间的欧氏距离，并将距离矩阵转换为矩阵格式。最后，我们使用`pheatmap`函数绘制热图，并将`clustering_distance_rows`和`clustering_distance_cols`参数设置为距离矩阵，以实现行和列的聚类分析。`scale`参数设置为"none"表示不对数据进行缩放。