python提取脑电微分熵特征
时间: 2023-07-26 07:45:02 浏览: 123
在Python中,可以使用MNE-Python库来提取脑电信号的微分熵特征。下面是一个基本的脑电信号微分熵特征提取的代码示例:
```
import mne
import numpy as np
# 读取脑电数据文件
raw = mne.io.read_raw_edf('data.edf')
# 选择要处理的通道
picks = mne.pick_channels(raw.info['ch_names'], ['F3', 'F4', 'C3', 'C4', 'O1', 'O2'])
# 获取脑电数据和采样频率
data, sfreq = raw[picks]
# 计算微分熵特征
de = mne.features.differential_entropy(data, sfreq=sfreq, ch_names=picks)
# 输出微分熵特征值
print(de)
```
在上面的代码中,首先使用`mne.io.read_raw_edf()`函数读取脑电数据文件,然后使用`mne.pick_channels()`函数选择要处理的通道。接着,使用`raw[picks]`获取所选通道的脑电数据和采样频率,然后使用`mne.features.differential_entropy()`函数计算微分熵特征。最后,输出微分熵特征值。需要注意的是,在实际应用中,可能需要对微分熵特征进行归一化或者对多个通道的微分熵特征进行合并等处理。
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Python提取的脑电微分熵特征怎么导出为mat文件
你可以使用Python中的`scipy.io.savemat()`函数将提取的脑电微分熵特征导出为mat文件。下面是示例代码:
```python
import scipy.io as sio
# 提取微分熵特征
diff_entropies = extract_features(eeg_data, fs)
# 导出为mat文件
sio.savemat('diff_entropies.mat', {'diff_entropies': diff_entropies})
```
以上代码中,`diff_entropies`为提取的脑电微分熵特征,使用`sio.savemat()`函数将`diff_entropies`存储在`diff_entropies.mat`文件中,文件中的变量名为`diff_entropies`。
torch 提取脑电信号的微分熵特征 代码
以下是使用 PyTorch 提取脑电信号微分熵特征的代码:
```python
import torch
import numpy as np
from scipy.signal import argrelextrema
# 定义微分熵特征提取函数
def diff_entropy(signal, m=2, r=0.3):
n = len(signal)
signal = np.array(signal)
diff_signal = np.diff(signal)
# 计算所有可能性的向量间距
vectors = np.zeros((n - (m - 1) * (r * n - 1), m))
for i in range(m):
vectors[:, i] = signal[i * r * (n - 1):(i * r * (n - 1) + n - (m - 1) * r * (n - 1))]
dists = np.zeros((n - (m - 1) * (r * n - 1), n - (m - 1) * (r * n - 1)))
for i in range(len(vectors)):
for j in range(len(vectors)):
dists[i, j] = np.sqrt(np.sum((vectors[i] - vectors[j])**2))
# 计算微分熵
count = 0
diff_ent = 0
for i in range(len(vectors)):
for j in range(len(vectors)):
if dists[i, j] > 0:
count += 1
diff_ent += -np.log(dists[i, j])
diff_ent /= count
return diff_ent
# 加载脑电信号数据
data = np.load('eeg_data.npy')
# 提取微分熵特征
diff_ent_features = []
for i in range(len(data)):
channel_features = []
for j in range(data.shape[1]):
signal = data[i, j]
channel_features.append(diff_entropy(signal))
diff_ent_features.append(channel_features)
# 转换为 PyTorch 张量
diff_ent_features = torch.tensor(diff_ent_features)
```
代码中的 `diff_entropy` 函数计算了一个时间序列信号的微分熵,该信号被分成长度为 `m` 的向量,向量之间的间距为 `r`,然后计算所有向量之间的距离,并计算它们的对数和。最后,将对数和除以向量之间的总数,得到微分熵。
在代码中,我们加载一个名为 `eeg_data.npy` 的 NumPy 数组,该数组包含了多个脑电信号的时间序列数据。使用 `diff_entropy` 函数,我们可以提取每个信号的微分熵特征,并将这些特征存储在一个名为 `diff_ent_features` 的 PyTorch 张量中。