torch 提取脑电信号的微分熵特征 代码
时间: 2023-11-19 15:06:45 浏览: 85
以下是使用 PyTorch 提取脑电信号微分熵特征的代码:
```python
import torch
import numpy as np
from scipy.signal import argrelextrema
# 定义微分熵特征提取函数
def diff_entropy(signal, m=2, r=0.3):
n = len(signal)
signal = np.array(signal)
diff_signal = np.diff(signal)
# 计算所有可能性的向量间距
vectors = np.zeros((n - (m - 1) * (r * n - 1), m))
for i in range(m):
vectors[:, i] = signal[i * r * (n - 1):(i * r * (n - 1) + n - (m - 1) * r * (n - 1))]
dists = np.zeros((n - (m - 1) * (r * n - 1), n - (m - 1) * (r * n - 1)))
for i in range(len(vectors)):
for j in range(len(vectors)):
dists[i, j] = np.sqrt(np.sum((vectors[i] - vectors[j])**2))
# 计算微分熵
count = 0
diff_ent = 0
for i in range(len(vectors)):
for j in range(len(vectors)):
if dists[i, j] > 0:
count += 1
diff_ent += -np.log(dists[i, j])
diff_ent /= count
return diff_ent
# 加载脑电信号数据
data = np.load('eeg_data.npy')
# 提取微分熵特征
diff_ent_features = []
for i in range(len(data)):
channel_features = []
for j in range(data.shape[1]):
signal = data[i, j]
channel_features.append(diff_entropy(signal))
diff_ent_features.append(channel_features)
# 转换为 PyTorch 张量
diff_ent_features = torch.tensor(diff_ent_features)
```
代码中的 `diff_entropy` 函数计算了一个时间序列信号的微分熵,该信号被分成长度为 `m` 的向量,向量之间的间距为 `r`,然后计算所有向量之间的距离,并计算它们的对数和。最后,将对数和除以向量之间的总数,得到微分熵。
在代码中,我们加载一个名为 `eeg_data.npy` 的 NumPy 数组,该数组包含了多个脑电信号的时间序列数据。使用 `diff_entropy` 函数,我们可以提取每个信号的微分熵特征,并将这些特征存储在一个名为 `diff_ent_features` 的 PyTorch 张量中。
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