scale_fill_gradientn
时间: 2023-04-23 15:06:23 浏览: 310
scale_fill_gradientn是ggplot2中的一个函数,用于设置离散变量的颜色填充。它可以根据指定的颜色和值范围,将离散变量映射到不同的颜色。具体来说,它可以根据指定的颜色数量和值范围,生成一个渐变色的调色板,并将离散变量映射到该调色板上的不同颜色。
相关问题
斯皮尔曼相关系数的色阶设置scale_fill_gradientn
斯皮尔曼相关系数的色阶设置可以使用 `scale_fill_gradientn` 函数来实现。该函数可以自定义渐变色的颜色和取值范围,如下所示:
```R
library(ggplot2)
# 假设有一个斯皮尔曼相关系数矩阵,名为spearman_matrix
# 使用ggplot2绘制热图
ggplot(data = melt(spearman_matrix), aes(x = Var1, y = Var2, fill = value)) +
geom_tile() +
scale_fill_gradientn(colors = c("blue", "white", "red"), values = c(-1, 0, 1))
```
代码解释:
1. `melt()` 函数将斯皮尔曼相关系数矩阵转换为长格式,方便后续绘图操作。
2. `aes()` 函数中,`x` 和 `y` 分别指定热图的行和列,`fill` 指定填充颜色的取值为相关系数的值。
3. `geom_tile()` 函数用于绘制热图的方块。
4. `scale_fill_gradientn()` 函数用于设置渐变色的颜色和取值范围。`colors` 参数指定渐变色的颜色范围,`values` 参数指定渐变色的取值范围,取值范围应与相关系数的范围一致。在上面的例子中,取值范围为 -1 到 1,颜色范围为蓝色到白色到红色。
需要注意的是,渐变色的颜色和取值范围应该根据具体的数据来选择,以达到更好的展示效果。
ggplot(mydata,aes(x=Var1,y=Var2))+ + geom_point(aes(size=AbsValue,fill=value),shape=21,colour=black)+ + scale_fill_gradientn(colours = c(brewer.pal(7,"Set1")[2],"white",brewer.pal(7,"Set1")[1]),na.value = NA)+ + scale_size_area(max_size = 12,guide=FALSE) 错误: 找不到对象'black'
这段代码中的问题在于第一行和第二行之间多了一个加号。应该将这个加号去掉,修改后的代码如下:
```R
ggplot(mydata,aes(x=Var1,y=Var2)) +
geom_point(aes(size=AbsValue,fill=value),shape=21,colour="black") +
scale_fill_gradientn(colours = c(brewer.pal(7,"Set1")[2],"white",brewer.pal(7,"Set1")[1]),na.value = NA) +
scale_size_area(max_size = 12,guide=FALSE)
```
这样就可以正常运行了。在第二行中,将 `colour` 参数的取值改为 `"black"` 即可。