计算fasta文件中每个氨基酸个数Python不使用Biopython

好的，我明白了您的问题。下面是Python代码：

# 读取fasta文件
fasta_file = open("example.fasta", "r")
fasta_lines = fasta_file.readlines()

# 去除标题行
fasta_lines.pop(0)

# 拼接序列行
sequence = ''.join(fasta_lines).replace('\n', '')

# 统计每个氨基酸出现的次数
amino_acids = {}
for amino_acid in sequence:
    if amino_acid in amino_acids:
        amino_acids[amino_acid] += 1
    else:
        amino_acids[amino_acid] = 1

# 输出结果
for key, value in amino_acids.items():
    print(key + ': ' + str(value))

这段代码读取一个名为example.fasta的fasta文件，统计其中每个氨基酸出现的次数，最终输出结果。如果您想处理其他fasta文件，只需要在代码中修改相应的文件名即可。

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3.统计氨基酸NC_045512_N.fasta文件中每种氨基酸的数目，并绘制条形图，要求从左到右按从高到低排列，标注横纵坐标的标签和名称，并将条带的颜色设置为 '#8DD3C7'。

在Python中，我们可以使用生物信息学库如BioPython来处理FASTA文件并统计氨基酸的数量，然后利用matplotlib库绘制条形图。以下是步骤的一个简要概述：

首先，需要安装`biopython`库（如果未安装）：

pip install biopython

然后，你可以编写这样的代码：

from Bio import SeqIO
import matplotlib.pyplot as plt

# 读取FASTA文件
with open("NC_045512_N.fasta", "r") as file:
    records = list(SeqIO.parse(file, "fasta"))

# 统计每个氨基酸的频率
amino_acids = {aa: sum(1 for r in records if aa in str(r.seq)) for aa in 'ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'}

# 按频率排序
sorted_amino_acids = sorted(amino_acids.items(), key=lambda x: x[1], reverse=True)

# 绘制条形图
fig, ax = plt.subplots()
x_labels, y_values = zip(*sorted_amino_acids)
ax.bar(x_labels, y_values, color='#8DD3C7')
ax.set_xlabel('氨基酸')
ax.set_ylabel('频数')
ax.set_title('氨基酸在NC_045512_N.fasta中的分布')

# 横向标签从高到低排列
ax.xaxis.tick_top()
ax.invert_yaxis()

plt.show()

这个脚本会统计给定FASTA文件中每个氨基酸的出现次数，并按照频率由高到低绘制条形图，横坐标表示氨基酸，纵坐标表示频数，颜色设置为'#8DD3C7'。