R代码library(splines)# 定义输入坐标x <- seq(0, 2*pi, length.out = 20)y <- seq(0, 2*pi, length.out = 20)# 创建 X 和 Y 矩阵X <- as.matrix(rep(x, length(y)))Y <- as.matrix(rep(y, each = length(x)))# 创建 Z 矩阵Z <- sin(X) * cos(Y)# 创建 B 样条对象bs <- smooth.2d(Z, x, y)# 计算 B 样条曲面上的值Z_pred <- predict(bs, eval.grid = list(x = x, y = y))# 可视化结果library(plotly)plot_ly(x = X, y = Y, z = Z_pred, type = "surface"),运行后bs <- smooth.2d(Z, x, y)出现错误,Error in x[, 1] : incorrect number of dimensions是为什么,应该怎么改

时间: 2023-12-13 14:06:00 浏览: 185
这个错误可能是因为 `smooth.2d()` 函数的输入参数 `x` 和 `y` 不是矩阵或数组。你可以尝试将它们转换成矩阵或数组,使用以下代码行来替换原来的代码: ``` X <- matrix(rep(x, length(y)), nrow = length(x), ncol = length(y)) Y <- matrix(rep(y, each = length(x)), nrow = length(x), ncol = length(y)) ``` 这样,你就可以将 `X` 和 `Y` 作为输入参数传递给 `smooth.2d()` 函数,代码变成: ``` bs <- smooth.2d(Z, X, Y) ``` 然后运行后面的代码就可以得到预期的结果了。
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library(dlnm);library(splines); range <- range(data$tmean,na.rm=T) nknots<-3 # Number of knots for temperature nlagknots<-2 # Number of knots for lag ktmean <- range[1] + (range[2]-range[1])/(nknots+1)*1:nknots # Knots for temperature klag<-c(1.4,5.5) # Knots for lag basis.tmean <- crossbasis(data$tmean,lag=21,argvar=list(fun="ns",knots=ktmean), arglag=list(fun="ns",knots=klag)) summary(basis.tmean)\n model_TV01_All.cause_new <- glm(All.cause ~ ns(TV07,3)+ season2 + interaction_term_TV01 + basis.tmean + ns(RH,df=3) +ns(time, 8* 6)+as.factor(DOW), family=quasipoisson(), data) 我要绘制这个模型的TV07这个变量单独对于All.cause的coefficient效应图怎么画

要绘制模型中TV07变量单独对于All.cause的系数效应图,你可以使用`visreg`包来实现。以下是一个示例代码: ```R # 安装并加载visreg包 install.packages("visreg") library(visreg) # 提取TV07变量的效应 effect <- visreg(model_TV01_All.cause_new, "TV07") # 绘制TV07变量的效应图 plot(effect, col = "blue", lwd = 2, xlab = "TV07", ylab = "All.cause", main = "Effect of TV07 on All.cause") ``` 在上述代码中,我们假设你已经拟合了一个glm模型,并将其命名为`model_TV01_All.cause_new`。然后,我们使用`visreg()`函数提取TV07变量的效应。最后,我们使用`plot()`函数绘制TV07变量的效应图。 请注意,你需要根据你的实际模型名称进行相应的修改。 希望这个回答对你有帮助!如果你有其他问题,请随时提问。

library(splines) library(Matrix) library(fds) library(rainbow) library(MASS) library(pcaPP) library(RCurl) library(fda) library(ggplot2) data<-read.table("D:/CPCI/ECG200/ECG200_TEST.txt") data <- data[, -1] #导入数据的时候第一列是当时已经分好的类,不需要 #######定义了一个计算函数型数据马氏距离的函数 Ma_distance <-function(data,M,H,param){ ###data:导入数据;M:B样条基个数;H:主成分个数;param:控制平滑程度 knee= t(data) t=ncol(data) #使用前需要把data转置 #调参 time = seq(0,1,len=t) smoothing.parameter = param #控制平滑程度(原来是1e-15 Lfdobj = int2Lfd(2) kneebasis = create.bspline.basis(nbasis=M) #选择多少个B样条基(原来给的是20个 kneefdPar = fdPar(kneebasis, Lfdobj, smoothing.parameter) knee.fd = smooth.basis(time, knee, kneefdPar) kn.pcastr = pca.fd(knee.fd$fd, H, kneefdPar,centerfns=TRUE) #设置主成分个数 kneescores = kn.pcastr$scores ##主成分得分 lambda = kn.pcastr$varprop #lambda a=nrow(data) #获取样本个数 b=ncol(kneescores) #获取主成分个数 Mdis=matrix(0,nrow = a,ncol = a) for (i in 1:a) { for (j in 1:a) { l = as.matrix(kneescores[i,]-kneescores[j,]) #主成分得分的第i行-第J行,两个主成分得分向量相减得到的向量 dim(l) = c(1,H) #将向量l的维度由(1,t)设置为(1,H) b = 1/lambda #lambda的向量,维度为(1,H) dim(b)=c(H,1) #将向量lambda的维度改成(1,H) Mdis[i,j]=sqrt((l^2)%*%b) #矩乘 } } #获取基展开系数 coefs <- kn.pcastr$harmonics$harmonics return(Mdis) } write.csv (Mdis, file ="D:/CPCI/D.csv")

这段代码包含了一个计算函数型数据马氏距离的函数Ma_distance,以及对导入的数据进行一些预处理的代码。具体来说,这段代码做了以下几件事情: 1. 导入了需要处理的数据,即ECG200_TEST.txt文件中的数据。第一列是类别信息,因此在导入数据时将其删除。 2. 定义了一个名为Ma_distance的函数,用于计算函数型数据的马氏距离。该函数接受四个参数:data表示输入的数据,M表示B样条基的个数,H表示主成分的个数,param表示平滑参数,用于控制平滑的程度。 3. 在Ma_distance函数中,首先将输入的数据转置,以便进行后续的计算。 4. 接着,根据输入的参数M和param,创建B样条基和平滑参数对象,并使用smooth.basis函数对数据进行平滑处理,得到一个函数对象knee.fd。 5. 使用pca.fd函数对knee.fd的函数系数进行主成分分析,得到主成分得分和方差贡献比lambda。 6. 根据主成分得分,计算样本之间的马氏距离,并将结果存储在Mdis矩阵中。 7. 最后,将Mdis矩阵写入到D.csv文件中。 需要注意的是,该段代码中的Mdis变量没有被定义,因此需要先运行Ma_distance函数并将结果赋值给Mdis变量,然后才能将其写入到文件中。另外,该段代码中导入的包需要提前安装并加载。
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将以下代码改为C++代码: import scipy.special as sp import numpy as np import numba from numba import njit,prange import math import trimesh as tri fileName="data/blub.obj" outName='./output/blub_rec.obj' # 参数 # 限制选取球谐基函数的带宽 bw=64 # 极坐标,经度0<=theta<2*pi,纬度0<=phi<pi; # (x,y,z)=r(sin(phi)cos(theta),sin(phi)sin(theta),cos(phi)) def get_angles(x,y,z): r=np.sqrt(x*x+y*y+z*z) x/=r y/=r z/=r phi=np.arccos(z) if phi==0: theta=0 theta=np.arccos(x/np.sin(phi)) if y/np.sin(phi)<0: theta+=math.pi return [theta,phi] if __name__=='__main__': # 载入网格 mesh=tri.load(fileName) # 获得网格顶点(x,y,z)对应的(theta,phi) numV=len(mesh.vertices) angles=np.zeros([numV,2]) for i in range(len(mesh.vertices)): v=mesh.vertices[i] [angles[i,0],angles[i,1]]=get_angles(v[0],v[1],v[2]) # 求解方程:x(theta,phi)=对m,l求和 a^m_lY^m_l(theta,phi) 解出系数a^m_l # 得到每个theta,phi对应的x X,Y,Z=np.zeros([numV,1]),np.zeros([numV,1]),np.zeros([numV,1]) for i in range(len(mesh.vertices)): X[i],Y[i],Z[i]=mesh.vertices[i,0],mesh.vertices[i,1],mesh.vertices[i,2] # 求出Y^m_l(theta,phi)作为矩阵系数 sph_harm_values=np.zeros([numV,(bw+1)*(bw+1)]) for i in range(numV): for l in range(bw): for m in range(-l,l+1): sph_harm_values[i,l*(l+1)+m]=sp.sph_harm(m,l,angles[i,0],angles[i,1]) print('系数矩阵维数:{}'.format(sph_harm_values.shape)) # 求解方程组,得到球谐分解系数 a_x=np.linalg.lstsq(sph_harm_values,X,rcond=None)[0] a_y=np.linalg.lstsq(sph_harm_values,Y,rcond=None)[0] a_z=np.linalg.lstsq(sph_harm_values,Z,rcond=None)[0] # 从系数恢复的x,y,z坐标,存为新的点云用于比较 x=np.matmul(sph_harm_values,a_x) y=np.matmul(sph_harm_values,a_y) z=np.matmul(sph_harm_values,a_z) with open(outName,'w') as output: for i in range(len(x)): output.write("v %f %f %f\n"%(x[i,0],y[i,0],z[i,0]))

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