metrics.roc_auc_score

时间: 2023-04-26 08:00:18 浏览: 118
metrics.roc_auc_score是一个用于计算ROC曲线下面积(ROC AUC)的函数,通常用于二元分类模型的性能评估。ROC AUC是一个介于0和1之间的值,数值越大表示模型的性能越好。当ROC AUC等于0.5时,表示模型的预测性能与随机猜测相当,而当ROC AUC等于1时,表示模型的预测性能完美。
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sklearn.metrics.roc_auc_score

`sklearn.metrics.roc_auc_score` 是 Scikit-learn 中用于计算二分类模型 ROC 曲线下面积(AUC)的函数。 在使用该函数时,你需要提供真实标签 `y_true` 和预测标签 `y_pred`。其中,`y_true` 是一个长度为 `n_samples` 的一维数组,表示每个样本的真实标签;`y_pred` 是一个长度为 `n_samples` 的一维数组,表示模型对每个样本的预测标签。 下面是一个简单的例子: ```python from sklearn.metrics import roc_auc_score y_true = [0, 0, 1, 1] y_pred = [0.1, 0.4, 0.35, 0.8] roc_auc = roc_auc_score(y_true, y_pred) print("ROC AUC score:", roc_auc) ``` 在这个例子中,`y_true` 表示四个样本的真实标签,分别为 0、0、1、1;`y_pred` 表示模型对这四个样本的预测概率,分别为 0.1、0.4、0.35、0.8。函数的返回值 `roc_auc` 表示模型的 ROC 曲线下面积,即 0.75。

Sklearn.metrics.roc_auc_score模块中的源代码

以下是sklearn.metrics.roc_auc_score模块的源代码: ```python def roc_auc_score(y_true, y_score, average='macro', sample_weight=None, max_fpr=None, multi_class='raise', labels=None): """Compute Area Under the Receiver Operating Characteristic Curve (ROC AUC) from prediction scores. Note: this implementation can be used with binary, multiclass and multilabel classification, but some restrictions apply (see Parameters). Read more in the :ref:`User Guide <roc_metrics>`. Parameters ---------- y_true : array-like of shape (n_samples,) or (n_samples, n_classes) True labels or binary label indicators. The binary and multiclass cases expect labels with shape (n_samples,) while the multilabel case expects binary label indicators with shape (n_samples, n_classes). y_score : array-like of shape (n_samples,) or (n_samples, n_classes) Target scores. In the binary and multilabel cases, these can be either probability estimates or non-thresholded decision values (as returned by `decision_function` on some classifiers). In the multiclass case, these must be probability estimates which sum to 1. The binary case expects a shape (n_samples,), and the scores must be the scores of the class with the greater label. The multiclass and multilabel cases expect a shape (n_samples, n_classes). average : {'micro', 'macro', 'samples', 'weighted'} or None, \ default='macro' If ``None``, the scores for each class are returned. Otherwise, this determines the type of averaging performed on the data: ``'micro'``: Calculate metrics globally by counting the total true positives, false negatives and false positives. ``'macro'``: Calculate metrics for each label, and find their unweighted mean. This does not take label imbalance into account. ``'weighted'``: Calculate metrics for each label, and find their average, weighted by support (the number of true instances for each label). This alters 'macro' to account for label imbalance; it can result in an F-score that is not between precision and recall. ``'samples'``: Calculate metrics for each instance, and find their average (only meaningful for multilabel classification). sample_weight : array-like of shape (n_samples,), default=None Sample weights. max_fpr : float or None, default=None If not ``None``, the standardized partial AUC [2]_ over the range [0, max_fpr] is returned. For the multiclass case, ``max_fpr`` should be either ``None`` or ``1.0`` as partial AUC makes sense for binary classification only. multi_class : {'raise', 'ovr', 'ovo'}, default='raise' Multiclass only. Determines the type of configuration to use. The default value raises an error, so either ``'ovr'`` or ``'ovo'`` must be passed explicitly. ``'ovr'``: Computes ROC curve independently for each class. For each class, the binary problem y_true == i or not is solved and the corresponding ROC curve is computed and averaged across classes. This is a commonly used strategy for multiclass or multi-label classification problems. ``'ovo'``: Computes pairwise ROC curve for each pair of classes. For each pair of classes, the binary problem y_true == i or y_true == j is solved and the corresponding ROC curve is computed. The micro-averaged ROC curve is computed from the individual curves and hence is agnostic to the class balance. labels : array-like of shape (n_classes,), default=None Multiclass only. List of labels to index ``y_score`` used for multiclass. If ``None``, the lexical order of ``y_true`` is used to index ``y_score``. Returns ------- auc : float or dict (if ``multi_class`` is ``'ovo'`` or ``'ovr'``) AUC of the ROC curves. If ``multi_class`` is ``'ovr'``, then returns an array of shape ``(n_classes,)`` such that each element corresponds to the AUC of the ROC curve for a specific class. If ``multi_class`` is ``'ovo'``, then returns a dict where the keys are ``(i, j)`` tuples and the values are the AUCs of the ROC curve for the binary problem of predicting class ``i`` vs. class ``j``. See also -------- roc_curve : Compute Receiver operating characteristic (ROC) curve. roc_auc : Compute Area Under the Receiver Operating Characteristic Curve (ROC AUC) from prediction scores Examples -------- >>> import numpy as np >>> from sklearn.metrics import roc_auc_score >>> y_true = np.array([0, 0, 1, 1]) >>> y_scores = np.array([0.1, 0.4, 0.35, 0.8]) >>> roc_auc_score(y_true, y_scores) 0.75 >>> y_true = np.array([0, 0, 1, 1]) >>> y_scores = np.array([[0.1, 0.9], [0.4, 0.6], [0.35, 0.65], [0.8, 0.2]]) >>> roc_auc_score(y_true, y_scores, multi_class='ovo') 0.6666666666666667 >>> roc_auc_score(y_true, y_scores[:, 1]) 0.75 """ # validation of the input y_score if not (y_true.shape == y_score.shape): raise ValueError("y_true and y_score have different shape.") if (not is_multilabel(y_true) and not is_multiclass(y_true)): # roc_auc_score only supports binary and multiclass classification # for the time being if len(np.unique(y_true)) == 2: # Only one class present in y_true. ROC AUC score is not defined # in that case. Note that raising an error is consistent with the # deprecated roc_auc_score behavior. raise ValueError( "ROC AUC score is not defined in that case: " "y_true contains only one label ({0}).".format( format_label(y_true[0]) ) ) else: raise ValueError( "ROC AUC score is not defined in that case: " "y_true has {0} unique labels. ".format(len(np.unique(y_true))) + "ROC AUC score is defined only for binary or multiclass " "classification where the number of classes is greater than " "one." ) if multi_class == 'raise': raise ValueError("multi_class must be in ('ovo', 'ovr')") elif multi_class == 'ovo': if is_multilabel(y_true): # check if max_fpr is valid in this case if max_fpr is not None and (max_fpr == 0 or max_fpr > 1): raise ValueError("Expected max_fpr in range (0, 1], got: %f" % max_fpr) return _multiclass_roc_auc_score_ovr(y_true, y_score, average, sample_weight, max_fpr=max_fpr) else: return _binary_roc_auc_score(y_true, y_score, average, sample_weight, max_fpr=max_fpr) elif multi_class == 'ovr': if is_multilabel(y_true): return _multilabel_roc_auc_score_ovr(y_true, y_score, average, sample_weight) else: return _multiclass_roc_auc_score_ovr(y_true, y_score, average, sample_weight, labels=labels) else: raise ValueError("Invalid multi_class parameter: {0}".format(multi_class)) ``` 这段代码实现了计算ROC AUC的功能,支持二元、多类和多标签分类。其中,分为'ovo'和'ovr'两种多类模式,'ovo'表示一对一,'ovr'表示一对多。
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# 导入模块 import prettytable as pt from sklearn.metrics import accuracy_score from sklearn.metrics import precision_score from sklearn.metrics import recall_score, f1_score from sklearn.metrics import roc_curve, auc # 创建表格对象 table = pt.PrettyTable() # 设置表格的列名 table.field_names = ["acc", "precision", "recall", "f1", "roc_auc"] # 循环添加数据 # 20个随机状态 for i in range(1): # # GBDT GBDT = GradientBoostingClassifier(learning_rate=0.1, min_samples_leaf=14, min_samples_split=6, max_depth=10, random_state=i, n_estimators=267 ) # GBDT = GradientBoostingClassifier(learning_rate=0.1, n_estimators=142,min_samples_leaf=80,min_samples_split=296,max_depth=7 , max_features='sqrt', random_state=66 # ) GBDT.fit(train_x, train_y) y_pred = GBDT.predict(test_x) # y_predprob = GBDT.predict_proba(test_x) print(y_pred) print('AUC Score:%.4g' % metrics.roc_auc_score(test_y.values, y_pred)) # print('AUC Score (test): %f' %metrics.roc_auc_score(test_y.values,y_predprob[:,1])) accuracy = GBDT.score(val_x, val_y) accuracy1 = GBDT.score(test_x, test_y) print("GBDT最终精确度:{},{}".format(accuracy, accuracy1)) y_predict3 = GBDT.predict(test_x) get_score(test_y, y_predict3, model_name='GBDT') acc = accuracy_score(test_y, y_predict3) # 准确率 prec = precision_score(test_y, y_predict3) # 精确率 recall = recall_score(test_y, y_predict3) # 召回率 f1 = f1_score(test_y, y_predict3) # F1 fpr, tpr, thersholds = roc_curve(test_y, y_predict3) roc_auc = auc(fpr, tpr) data1 = acc data2 = prec data3 = recall data4 = f1 data5 = roc_auc # 将数据添加到表格中 table.add_row([data1, data2, data3, data4, data5]) print(table) import pandas as pd # 将数据转换为DataFrame格式 df = pd.DataFrame(list(table), columns=["acc","prec","recall","f1","roc_auc"]) # 将DataFrame写入Excel文件 writer = pd.ExcelWriter('output.xlsx') df.to_excel(writer, index=False) writer.save(),出现上面的错误怎样更正

import pandas as pd from sklearn import metrics from sklearn.model_selection import train_test_split import xgboost as xgb import matplotlib.pyplot as plt import openpyxl # 导入数据集 df = pd.read_csv("/Users/mengzihan/Desktop/正式有血糖聚类前.csv") data=df.iloc[:,:35] target=df.iloc[:,-1] # 切分训练集和测试集 train_x, test_x, train_y, test_y = train_test_split(data,target,test_size=0.2,random_state=7) # xgboost模型初始化设置 dtrain=xgb.DMatrix(train_x,label=train_y) dtest=xgb.DMatrix(test_x) watchlist = [(dtrain,'train')] # booster: params={'booster':'gbtree', 'objective': 'binary:logistic', 'eval_metric': 'auc', 'max_depth':12, 'lambda':10, 'subsample':0.75, 'colsample_bytree':0.75, 'min_child_weight':2, 'eta': 0.025, 'seed':0, 'nthread':8, 'gamma':0.15, 'learning_rate' : 0.01} # 建模与预测:50棵树 bst=xgb.train(params,dtrain,num_boost_round=50,evals=watchlist) ypred=bst.predict(dtest) # 设置阈值、评价指标 y_pred = (ypred >= 0.5)*1 print ('Precesion: %.4f' %metrics.precision_score(test_y,y_pred)) print ('Recall: %.4f' % metrics.recall_score(test_y,y_pred)) print ('F1-score: %.4f' %metrics.f1_score(test_y,y_pred)) print ('Accuracy: %.4f' % metrics.accuracy_score(test_y,y_pred)) print ('AUC: %.4f' % metrics.roc_auc_score(test_y,ypred)) ypred = bst.predict(dtest) print("测试集每个样本的得分\n",ypred) ypred_leaf = bst.predict(dtest, pred_leaf=True) print("测试集每棵树所属的节点数\n",ypred_leaf) ypred_contribs = bst.predict(dtest, pred_contribs=True) print("特征的重要性\n",ypred_contribs ) xgb.plot_importance(bst,height=0.8,title='影响糖尿病的重要特征', ylabel='特征') plt.rc('font', family='Arial Unicode MS', size=14) plt.show()

import pandas as pd from sklearn import metrics from sklearn.model_selection import train_test_split import xgboost as xgb import matplotlib.pyplot as plt # 导入数据集 df = pd.read_csv("./data/diabetes.csv") data=df.iloc[:,:8] target=df.iloc[:,-1]   # 切分训练集和测试集 train_x, test_x, train_y, test_y = train_test_split(data,target,test_size=0.2,random_state=7) # xgboost模型初始化设置 dtrain=xgb.DMatrix(train_x,label=train_y) dtest=xgb.DMatrix(test_x) watchlist = [(dtrain,'train')] # booster: params={'booster':'gbtree',         'objective': 'binary:logistic',         'eval_metric': 'auc',         'max_depth':5,         'lambda':10,         'subsample':0.75,         'colsample_bytree':0.75,         'min_child_weight':2,         'eta': 0.025,         'seed':0,         'nthread':8,         'gamma':0.15,         'learning_rate' : 0.01} # 建模与预测:50棵树 bst=xgb.train(params,dtrain,num_boost_round=50,evals=watchlist) ypred=bst.predict(dtest)   # 设置阈值、评价指标 y_pred = (ypred >= 0.5)*1 print ('Precesion: %.4f' %metrics.precision_score(test_y,y_pred)) print ('Recall: %.4f' % metrics.recall_score(test_y,y_pred)) print ('F1-score: %.4f' %metrics.f1_score(test_y,y_pred)) print ('Accuracy: %.4f' % metrics.accuracy_score(test_y,y_pred)) print ('AUC: %.4f' % metrics.roc_auc_score(test_y,ypred)) ypred = bst.predict(dtest) print("测试集每个样本的得分\n",ypred) ypred_leaf = bst.predict(dtest, pred_leaf=True) print("测试集每棵树所属的节点数\n",ypred_leaf) ypred_contribs = bst.predict(dtest, pred_contribs=True) print("特征的重要性\n",ypred_contribs ) xgb.plot_importance(bst,height=0.8,title='影响糖尿病的重要特征', ylabel='特征') plt.rc('font', family='Arial Unicode MS', size=14) plt.show()请问怎样设置这个代码的参数才合理,并且帮我分析一下哪里出了问题

根据以下代码,利用shap库写出绘制bar plot图的代码“def five_fold_train(x: pd.DataFrame, y: pd.DataFrame, model_class: type, super_parameters: dict = None, return_model=False): """ 5折交叉验证训练器 :param x: :param y: :param model_class: 学习方法类别,传入一个类型 :param super_parameters: 超参数 :param return_model: 是否返回每个模型 :return: list of [pred_y,val_y,auc,precision,recall] """ res = [] models = [] k_fold = KFold(5, random_state=456, shuffle=True) for train_index, val_index in k_fold.split(x, y): #即对数据进行位置索引,从而在数据表中提取出相应的数据 train_x, train_y, val_x, val_y = x.iloc[train_index], y.iloc[train_index], x.iloc[val_index], y.iloc[val_index] if super_parameters is None: super_parameters = {} model = model_class(**super_parameters).fit(train_x, train_y) pred_y = model.predict(val_x) auc = metrics.roc_auc_score(val_y, pred_y) precision = metrics.precision_score(val_y, (pred_y > 0.5) * 1) recall = metrics.recall_score(val_y, (pred_y > 0.5) * 1) res.append([pred_y, val_y, auc, precision, recall]) models.append(model) # print(f"fold: auc{auc} precision{precision} recall{recall}") if return_model: return res, models else: return res best_params = { "n_estimators": 500, "learning_rate": 0.05, "max_depth": 6, "colsample_bytree": 0.6, "min_child_weight": 1, "gamma": 0.7, "subsample": 0.6, "random_state": 456 } res, models = five_fold_train(x, y, XGBRegressor, super_parameters=best_params, return_model=True)”

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