将miRNA比用blast比对到参考基因组上,比对率较低是什么原因?
时间: 2023-03-19 14:25:21 浏览: 148
miRNA与参考基因组之间存在相当高的异质性和多态性,这些差异可能导致miRNA序列与参考基因组之间存在较大的差异,从而降低比对率。此外,miRNA序列长度较短,可能会增加误配率。因此,在比对miRNA序列到参考基因组时,需要选择合适的比对算法,并进行适当的参数调整,以提高比对率。
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miRNA_MIMAT是什么意思
miRNA_MIMAT是指microRNA的Mature Name,是一种非编码小RNA,长度约为20-24个核苷酸,可通过与靶基因mRNA的结合来调节基因表达。MIMAT是miRNA International Nomenclature Committee (miRBase)为每个已知成熟miRNA分配的唯一标识符,用于标识不同的成熟miRNA序列。因此,miRNA_MIMAT是一种用于标识和描述已知的microRNA序列的命名约定。
CirRNA和miRNA是什么
CirRNA(环状RNA)和miRNA(微小RNA)都是一类非编码RNA分子。CirRNA是一种闭合的环状RNA分子,其特点是在转录过程中形成一个环状结构,而不是线性的。它们在细胞内广泛存在,并且在调控基因表达、细胞增殖和发育等方面起着重要作用。
相比之下,miRNA是一类非编码的短RNA分子,通常由约21-23个核苷酸组成。miRNA主要通过与靶基因的mRNA结合,调控基因表达水平。它们在细胞中广泛存在,并且参与调节多种生物学过程,包括细胞周期、细胞分化、免疫应答等。
总的来说,CirRNA和miRNA都是一类重要的非编码RNA分子,它们在细胞内发挥着重要的调控作用。