不用matlab库函数实现层次聚类

时间: 2023-10-16 16:14:19 浏览: 39
层次聚类是一种无监督学习的聚类方法,其目标是根据样本之间的相似度(距离)将样本划分为不同的簇。以下是一种不使用Matlab库函数实现层次聚类的方法: 1. 初始化:将每个样本看作一个簇。 2. 计算相似矩阵:计算每两个簇之间的相似度(距离),可以使用欧氏距离或其他距离度量方法。 3. 合并:找到相似度最高的两个簇,将它们合并成一个新的簇。 4. 更新相似矩阵:重新计算新簇与其他簇之间的相似度。 5. 重复步骤3和4,直到所有样本被划分为一个簇或达到预设的簇数目。 6. 可视化:将结果可视化,可以使用树状图或其他可视化方法。 以下是一份Python代码示例: ```python import numpy as np def euclidean_distance(a, b): # 计算欧氏距离 return np.sqrt(np.sum(np.square(a - b))) def hierarchical_clustering(data, k): # 初始化:将每个样本看作一个簇 clusters = [i for i in range(data.shape[0])] # 计算距离矩阵 distances = np.zeros((data.shape[0], data.shape[0])) for i in range(data.shape[0]): for j in range(i + 1, data.shape[0]): distances[i, j] = euclidean_distance(data[i], data[j]) distances[j, i] = distances[i, j] # 合并簇 while len(set(clusters)) > k: # 找到距离最近的两个簇 i, j = np.unravel_index(np.argmin(distances), distances.shape) # 将它们合并成一个新的簇 for index, cluster in enumerate(clusters): if cluster == j: clusters[index] = i # 更新距离矩阵 for index in range(distances.shape[0]): if index != i and index != j: distances[i, index] = (distances[i, index] + distances[j, index]) / 2 distances[index, i] = distances[i, index] distances = np.delete(distances, j, axis=0) distances = np.delete(distances, j, axis=1) return clusters ``` 其中,`data`是一个$N \times M$的矩阵,表示$N$个样本的$M$维特征向量;`k`是聚类的簇数目。函数返回一个长度为$N$的列表,表示每个样本属于的簇的编号。可以使用`numpy`和`matplotlib`库进行数据处理和可视化。

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