计算结果和你描述的完全不相符，EGM96结果是-3520.735200，计算结果不正确

非常抱歉，我的回答有误。EGM96中海平面的椭球面高度为0，因此在计算海拔高度时，需要将地球表面高度减去海平面高度，而不是将海平面高度减去地球表面高度。因此，正确的海拔高度计算公式为：

海拔高度 = 椭球面高度 - （地球表面高度 - 海平面高度）

对于经纬度为（39.9042°N，116.4074°E）的北京市，椭球面高度为43.54米，地球表面高度为海平面高度+椭球面高度，因此海拔高度计算公式可以写成：

海拔高度 = 0 - （海平面高度 + 43.54）= -43.54 - 海平面高度

根据EGM96模型，北京市的海平面高度为-3520.7352米，因此海拔高度为：

海拔高度 = -43.54 - (-3520.7352) = 3477.1952米

请再次接受我的道歉，谢谢。