在PubMLST 网站（https://pubmlst.org/）没有找到 "cgMLST" 选项卡，能在详细说一下怎么找吗？

非常抱歉，我的回答有误。在 PubMLST 网站上，确实没有 "cgMLST" 选项卡。我混淆了两个不同的概念。

cgMLST（core genome multilocus sequence typing）是一种基于核心基因组的多位点序列分型方法，可以用于研究细菌菌株之间的遗传关系。而 PubMLST 是一个维护多种微生物的分型数据库，用于存储微生物的分型信息和相关注释。

如果您想使用 cgMLST 进行分析，可以在其他网站或软件中查找相关工具。其中一些常用的工具包括：BIGSdb、Ridom SeqSphere+ 和 chewBBACA。如果您需要更多帮助，请随时问我。

相关问题

怎么在pubmlst网站一步步比对cgmlst

以下是在 PubMLST 网站一步步比对 cgMLST 的方法：

1. 打开 PubMLST 网站（https://pubmlst.org/），在网站导航栏中选择“Schemes”选项卡，然后选择“CGMLST”（或者你想要比对的其他 MLST）。

2. 在 CGMLST 的页面上，你可以看到一个基于菌株的列表，该列表按照菌株名称和序列类型进行了分类。你需要选择你要比对的菌株，并点击该菌株下方的“Profile”按钮。

3. 在该菌株的 Profile 页面上，你可以看到该菌株的 cgMLST 分型结果。你需要将该结果与你要比对的其他菌株的结果逐个进行比较。

4. 如果你要比对多个菌株的 cgMLST 数据，你可以使用 PubMLST 网站提供的“Compare”功能。在 cgMLST 页面的顶部菜单栏中，选择“Compare”选项卡，并选择你要比对的菌株。

5. 在比对页面上，你可以看到每个菌株的 cgMLST 分型结果以及它们之间的共同分型信息。你可以使用这些信息来比较不同菌株之间的差异和相似性。

希望这些步骤可以帮助你在 PubMLST 网站上比对 cgMLST 数据。

怎么使用pubmlst网站做cgmlst进化树

要使用PubMLST网站构建cgMLST进化树，您需要执行以下步骤：

1.访问PubMLST网站（https://pubmlst.org/）并创建一个帐户。

2.选择您感兴趣的微生物菌株，并下载其cgMLST的数据。

3.使用在线工具如Gingr （https://github.com/gingr-browser/gingr）或Phyloviz（http://www.phyloviz.net/）进行基于cgMLST数据的进化树构建。在这些工具中，您可以上传您的数据，定义进化树的参数，并进行可视化和分析。

4.在构建完成后，您可以使用这些工具导出进化树并在您的研究中使用。

请注意，这只是cgMLST进化树构建的一般步骤，具体步骤可能会因软件和数据集而有所不同。您可能需要查看软件文档以获取更详细的指导。