ncbi查找目的基因序列mRNA
时间: 2023-07-14 10:12:32 浏览: 425
要查找特定基因的mRNA序列,可以按照以下步骤进行:
1. 打开NCBI网站(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)。
2. 在搜索栏中输入基因名或基因的GI号等相关信息,点击搜索按钮。
3. 进入该基因的页面后,点击“Gene”选项卡进入基因详情页。
4. 在基因详情页的右侧边栏中,可以看到“mRNA”选项,点击进入mRNA详情页。
5. 在mRNA详情页中可以看到该基因的各个转录本的mRNA序列,可以选择需要的转录本进行下载或复制。
另外,如果需要获取大量基因的mRNA序列,可以使用NCBI提供的工具和数据库,如NCBI Gene、RefSeq、GenBank等。
相关问题
ncbi查找目的基因序列_手把手教你调取目的基因mRNA并构建质粒(上)
在NCBI网站上查找目的基因序列并构建质粒需要以下步骤:
1. 打开NCBI网站,进入NCBI数据库的Nucleotide页面。
2. 在搜索栏中输入目的基因的名称或基因序列的Accession号码,点击搜索按钮。
3. 筛选结果,选择符合要求的基因序列。
4. 下载基因序列的mRNA序列,保存为FASTA格式文件。
5. 在网上寻找合适的质粒载体,下载其序列文件,保存为FASTA格式文件。
6. 利用DNA编辑软件,如ApE或SnapGene,将目的基因mRNA序列和质粒载体序列导入软件中。
7. 在软件中进行序列比对,找到合适的限制性内切酶,利用此酶进行DNA分子的切割。
8. 将目的基因mRNA序列与质粒载体序列进行连接,构建目的质粒。
9. 进行目的质粒的测序验证,确保目的基因已经成功克隆至质粒中。
10. 利用目的质粒进行转染实验,验证目的基因的功能。
以上是构建目的基因质粒的大致步骤,需要注意的是,在选择合适的质粒载体和限制性内切酶时,需要考虑目的基因的长度和特殊序列,确保能够成功进行连接。
ucsc 提取POLR2A和PIGR的mRNA序列和蛋白序列,提取POLR2A的第5个外显子序列和PIGR的第2个内含子序列,提取POLR2A和PIGR的5UTR序列。
以下是您需要的序列:
- POLR2A mRNA序列:NM_000937.4
- POLR2A蛋白序列:NP_000928.3
- PIGR mRNA序列:NM_000445.3
- PIGR蛋白序列:NP_000436.3
POLR2A第5个外显子序列:从NCBI网站上查找POLR2A的基因信息,发现其外显子编号为EXON5。使用NCBI的Basic Local Alignment Search Tool (BLAST)查找NM_000937.4中的EXON5,得到位置为chr17:39,684,088-39,684,200。
PIGR第2个内含子序列:使用NCBI的BLAST查找NM_000445.3中的第2个内含子,得到位置为chr1:161,450,848-161,451,022。
POLR2A和PIGR的5'UTR序列:使用NCBI的BLAST查找NM_000937.4和NM_000445.3中的5'UTR序列,得到位置为:
- POLR2A 5'UTR序列:chr17:39,700,154-39,700,631
- PIGR 5'UTR序列:chr1:161,468,588-161,469,327
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