roc图 r语言_如何用R语言画ROC曲线图?
时间: 2023-07-27 17:12:17 浏览: 100
ROC(Receiver Operating Characteristic)曲线是用于评估二分类模型性能的一种常用方法。在R语言中,可以使用pROC包来画ROC曲线图。
下面是一个简单的例子,假设有一个二分类模型,我们需要画出它的ROC曲线图:
首先,我们需要安装和载入pROC包:
```r
install.packages("pROC")
library(pROC)
```
接下来,我们需要准备数据,包括真实分类标签和模型预测的概率:
```r
# 假设真实标签为1,0,0,1,1,0,1,0,1,1
truth <- c(1,0,0,1,1,0,1,0,1,1)
# 假设模型预测的概率为0.8, 0.6, 0.3, 0.7, 0.9, 0.2, 0.6, 0.4, 0.7, 0.8
predictions <- c(0.8, 0.6, 0.3, 0.7, 0.9, 0.2, 0.6, 0.4, 0.7, 0.8)
```
然后,我们可以使用roc函数计算ROC曲线的各个点,并使用plot函数画图:
```r
# 计算ROC曲线
roc_obj <- roc(truth, predictions)
# 画ROC曲线图
plot(roc_obj, main="ROC Curve", print.auc=TRUE, legacy.axes=TRUE)
```
运行上述代码,即可得到ROC曲线图。其中,roc函数返回一个ROC对象,可以使用该对象的属性和方法获取更多信息,例如:
```r
# 输出AUC值
auc(roc_obj)
# 输出ROC曲线的各个点
coords(roc_obj)
# 输出敏感度和特异度
sensitivities(roc_obj, specificities=c(0.9, 0.95, 0.99))
specificities(roc_obj, sensitivities=c(0.8, 0.9, 0.95))
```
参考文献:
Robin X, Turck N, Hainard A, et al. pROC: an open-source package for R and S+ to analyze and compare ROC curves[J]. BMC bioinformatics, 2011, 12(1): 77.
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